156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1319 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 295 aa  611  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  81.57 
 
 		 618 aa  508  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  56.1 
 
 		 4489 aa  341  8e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  54.01 
 
 		 3560 aa  338  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  55.05 
 
 		 1094 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  54.01 
 
 		 3035 aa  322  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  51.77 
 
 		 1085 aa  318  7e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  54.06 
 
 		 732 aa  316  4e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  50.72 
 
 		 761 aa  295  7e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  49.82 
 
 		 647 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  48.44 
 
 		 660 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  50 
 
 		 492 aa  285  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  48.23 
 
 		 700 aa  276  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  47.02 
 
 		 452 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  44.88 
 
 		 740 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  45.04 
 
 		 654 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  45.13 
 
 		 459 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  46.47 
 
 		 569 aa  255  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  42.91 
 
 		 574 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  46.83 
 
 		 632 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  47.16 
 
 		 395 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  42.91 
 
 		 667 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  45.2 
 
 		 739 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  46.4 
 
 		 611 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  44.09 
 
 		 816 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  43.07 
 
 		 568 aa  238  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  42.29 
 
 		 750 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  43.79 
 
 		 616 aa  232  5e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 909 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.61 
 
 		 570 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  40.07 
 
 		 672 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 706 aa  216  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 		 750 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  37.91 
 
 		 657 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  39.58 
 
 		 680 aa  205  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  37.18 
 
 		 657 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  38.23 
 
 		 632 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 		 808 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  40.24 
 
 		 637 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  40.62 
 
 		 566 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  39.35 
 
 		 590 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  38.99 
 
 		 590 aa  195  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  37.05 
 
 		 633 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  37.37 
 
 		 560 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  38.41 
 
 		 588 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  37.77 
 
 		 630 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  36.24 
 
 		 624 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  35.19 
 
 		 582 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.03 
 
 		 1106 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.38 
 
 		 529 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  31.66 
 
 		 1596 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 		 1714 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1106 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  33.45 
 
 		 585 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 789 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 734 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 647 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 789 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 633 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  30.43 
 
 		 781 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  31.54 
 
 		 821 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.23 
 
 		 589 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  31.54 
 
 		 776 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  31.54 
 
 		 776 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  31.54 
 
 		 776 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 1143 aa  126  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.74 
 
 		 589 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 633 aa  126  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 776 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 776 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  31.12 
 
 		 821 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.8 
 
 		 699 aa  125  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 708 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 754 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 754 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 968 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  30.19 
 
 		 790 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 790 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  30.21 
 
 		 594 aa  123  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 738 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.48 
 
 		 708 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  28.52 
 
 		 1116 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 796 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  33.83 
 
 		 937 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  34.12 
 
 		 731 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  34.12 
 
 		 731 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 717 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 828 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 824 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  27.61 
 
 		 596 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 739 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  30.82 
 
 		 1415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 717 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 828 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  30.65 
 
 		 1144 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 619 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 828 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.07 
 
 		 667 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  29.76 
 
 		 715 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.47 
 
 		 742 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>