More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0153 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  96.42 
 
 
754 aa  1450    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  47.61 
 
 
789 aa  654    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
754 aa  1502    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  51.61 
 
 
732 aa  679    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  47.17 
 
 
828 aa  645    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  48.95 
 
 
828 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  45.8 
 
 
824 aa  649    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  49.08 
 
 
828 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  47.3 
 
 
833 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  42.69 
 
 
833 aa  548  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  50.08 
 
 
708 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  42.23 
 
 
626 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 
789 aa  449  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  46.14 
 
 
595 aa  445  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  45.72 
 
 
619 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  44.85 
 
 
598 aa  439  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 
718 aa  335  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 
909 aa  334  5e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 
713 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.88 
 
 
1106 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  35.26 
 
 
937 aa  323  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
717 aa  323  6e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
717 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  32.64 
 
 
797 aa  320  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  33.38 
 
 
715 aa  320  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 
821 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 
776 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 
776 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  33.03 
 
 
776 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 
968 aa  317  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.47 
 
 
667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 
1106 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  31.99 
 
 
708 aa  313  4.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.08 
 
 
589 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.15 
 
 
739 aa  313  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  32.63 
 
 
821 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.47 
 
 
589 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
776 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
776 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  37.35 
 
 
585 aa  310  8e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  33.42 
 
 
781 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
3035 aa  306  7e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.4 
 
 
816 aa  304  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  33.16 
 
 
1221 aa  303  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
750 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  33.62 
 
 
596 aa  300  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.54 
 
 
739 aa  297  5e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 
1714 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  32.87 
 
 
699 aa  292  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 
3560 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.81 
 
 
742 aa  292  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.17 
 
 
790 aa  286  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 
790 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 
1085 aa  283  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.72 
 
 
739 aa  282  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.09 
 
 
740 aa  280  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
1094 aa  279  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
4489 aa  279  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.64 
 
 
723 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 
779 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
796 aa  277  5e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 
627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
633 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
734 aa  274  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
780 aa  273  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  32.47 
 
 
780 aa  273  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
808 aa  273  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  30.83 
 
 
1415 aa  271  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
693 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.77 
 
 
529 aa  261  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 
633 aa  261  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
822 aa  260  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  30.51 
 
 
1144 aa  253  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29.78 
 
 
1143 aa  251  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 
700 aa  250  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
974 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
739 aa  238  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  31.57 
 
 
921 aa  237  7e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 
727 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 
654 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 
793 aa  228  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  29.8 
 
 
1116 aa  227  7e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
750 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 
733 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
732 aa  219  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
667 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
761 aa  217  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  29.42 
 
 
647 aa  213  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  29.69 
 
 
680 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
706 aa  207  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 
632 aa  203  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
611 aa  202  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  34.17 
 
 
552 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  31.31 
 
 
624 aa  197  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 
724 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 
740 aa  196  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  35.69 
 
 
588 aa  196  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.13 
 
 
810 aa  195  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.22 
 
 
1154 aa  194  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  33.86 
 
 
633 aa  194  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>