185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0103 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
733 aa  1498    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  42.25 
 
 
1221 aa  347  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  35.86 
 
 
1415 aa  333  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 
828 aa  303  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 
828 aa  301  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
828 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  35.81 
 
 
921 aa  295  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.86 
 
 
699 aa  278  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
789 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
732 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 
626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 
789 aa  270  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
833 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 
833 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  40.6 
 
 
734 aa  265  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 
824 aa  263  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
708 aa  262  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.57 
 
 
589 aa  262  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
1714 aa  258  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.68 
 
 
589 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 
667 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 
754 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
619 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  34.17 
 
 
693 aa  251  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  31.51 
 
 
585 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 
598 aa  250  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
754 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  33.55 
 
 
596 aa  247  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.23 
 
 
1106 aa  241  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
968 aa  240  6.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.18 
 
 
529 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  30.19 
 
 
797 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.31 
 
 
790 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  35.34 
 
 
790 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  34.9 
 
 
595 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  36.19 
 
 
708 aa  229  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  36.68 
 
 
727 aa  226  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 
627 aa  226  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  36.44 
 
 
633 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  36.41 
 
 
1106 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 
822 aa  218  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  30.02 
 
 
937 aa  216  9e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29.98 
 
 
1143 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  35.79 
 
 
1116 aa  214  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
717 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
776 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 
821 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 
776 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 
776 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 
776 aa  213  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  31.15 
 
 
821 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 
717 aa  213  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
776 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 
781 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  33.06 
 
 
780 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
780 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
779 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
713 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
796 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
647 aa  199  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 
633 aa  198  3e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  33.88 
 
 
1144 aa  195  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
718 aa  193  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
3035 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.97 
 
 
739 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
3560 aa  190  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.42 
 
 
793 aa  188  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.83 
 
 
740 aa  187  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.47 
 
 
739 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
1094 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  28.71 
 
 
552 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.86 
 
 
723 aa  183  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
909 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  26.06 
 
 
553 aa  178  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  24.64 
 
 
715 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 
739 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 
750 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
616 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
808 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  26.95 
 
 
719 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.43 
 
 
739 aa  172  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 
974 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
761 aa  168  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
700 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  31.1 
 
 
630 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.54 
 
 
742 aa  164  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
706 aa  164  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  30.25 
 
 
740 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
654 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
618 aa  163  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 
739 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
738 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  29.76 
 
 
745 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 
4489 aa  160  7e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  29.07 
 
 
568 aa  160  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  32.18 
 
 
632 aa  160  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
1085 aa  160  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  30.08 
 
 
680 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
611 aa  159  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  31.63 
 
 
459 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>