More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4439 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 715 aa  1464    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  71.25 
 
 		 713 aa  1058    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  42.42 
 
 		 739 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  41.22 
 
 		 739 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  41.67 
 
 		 742 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.76 
 
 		 740 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.49 
 
 		 739 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 		 699 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 754 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 754 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.22 
 
 		 1106 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 708 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 789 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 1106 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 824 aa  297  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 732 aa  289  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 3035 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  31.13 
 
 		 937 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 3560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 		 717 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 717 aa  280  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 968 aa  277  5e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  32.82 
 
 		 790 aa  277  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.65 
 
 		 790 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.16 
 
 		 708 aa  275  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 828 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 828 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 718 aa  270  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.13 
 
 		 667 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 779 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 4489 aa  268  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 1714 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  31.38 
 
 		 781 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 		 734 aa  263  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  34.4 
 
 		 585 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  31.65 
 
 		 780 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 780 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  30.85 
 
 		 1221 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 1094 aa  254  5.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 627 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 828 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 647 aa  250  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  29.31 
 
 		 797 aa  249  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  27.86 
 
 		 821 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 776 aa  249  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 633 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.23 
 
 		 529 aa  248  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 776 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  29.12 
 
 		 1415 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  31.24 
 
 		 833 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  27.96 
 
 		 821 aa  247  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 761 aa  247  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 		 776 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 		 776 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 		 776 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 626 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 693 aa  244  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1085 aa  241  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 974 aa  240  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 789 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 633 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 822 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 619 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 740 aa  237  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 833 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 598 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.52 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.63 
 
 		 723 aa  234  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.68 
 
 		 589 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.54 
 
 		 589 aa  230  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 739 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.38 
 
 		 816 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 796 aa  228  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 732 aa  226  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.81 
 
 		 1116 aa  226  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 595 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 		 750 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  30.62 
 
 		 921 aa  221  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 808 aa  216  9e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 1143 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 909 aa  214  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  31.25 
 
 		 553 aa  210  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 700 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  29.28 
 
 		 552 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 706 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 667 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 727 aa  187  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  31.76 
 
 		 1144 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 647 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 660 aa  182  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 618 aa  178  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 632 aa  174  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.33 
 
 		 793 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 724 aa  166  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 654 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 672 aa  160  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 927 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 616 aa  159  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 750 aa  159  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 733 aa  158  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>