More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0122 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 660 aa  1360    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  41.9 
 
 		 3560 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  40.76 
 
 		 3035 aa  508  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  40.88 
 
 		 761 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  43.22 
 
 		 4489 aa  472  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 		 1094 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  37.99 
 
 		 732 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 		 618 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 		 647 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 654 aa  372  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 667 aa  372  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 700 aa  353  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 		 1085 aa  353  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 740 aa  333  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 739 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  33.02 
 
 		 750 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 611 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 909 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  32.91 
 
 		 816 aa  311  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 		 569 aa  296  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 706 aa  294  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  38.2 
 
 		 492 aa  293  9e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  42.56 
 
 		 395 aa  289  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  48.44 
 
 		 295 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  31.8 
 
 		 560 aa  277  4e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  38.08 
 
 		 459 aa  276  6e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 616 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  35.87 
 
 		 452 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  29.91 
 
 		 632 aa  264  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 808 aa  261  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 		 590 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 632 aa  250  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  32.9 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  30.58 
 
 		 680 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  28.7 
 
 		 568 aa  246  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 750 aa  238  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.79 
 
 		 570 aa  237  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 672 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  36.16 
 
 		 633 aa  234  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  35.51 
 
 		 657 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  35.23 
 
 		 657 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  33.24 
 
 		 637 aa  216  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  33.24 
 
 		 566 aa  210  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  28.14 
 
 		 585 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 718 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  31.43 
 
 		 630 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 968 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 713 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.62 
 
 		 1106 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  29.56 
 
 		 588 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 		 734 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  24.46 
 
 		 699 aa  183  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  31.28 
 
 		 624 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.72 
 
 		 715 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1106 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 		 529 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 828 aa  180  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 789 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 708 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 		 589 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 1143 aa  177  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 727 aa  176  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 619 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00265  UDP-N-acetylglucosaminyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G03380)  29.05 
 
 		 1596 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0115382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  26.23 
 
 		 596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 595 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1714 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 627 aa  173  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 598 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 717 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 647 aa  168  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 		 667 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 717 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  25.83 
 
 		 708 aa  165  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 824 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  29.38 
 
 		 719 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  29.41 
 
 		 582 aa  163  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.8 
 
 		 742 aa  163  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 633 aa  162  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0605  tetratricopeptide domain-containing protein  24.06 
 
 		 553 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.335277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  25.5 
 
 		 1221 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 626 aa  160  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 738 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 739 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 776 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 776 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  24.66 
 
 		 821 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 789 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 828 aa  158  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 796 aa  156  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  24.49 
 
 		 821 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  24.49 
 
 		 776 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  24.49 
 
 		 776 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 828 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  24.79 
 
 		 937 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  24.49 
 
 		 776 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 833 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 822 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>