More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2523 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  100 
 
 
795 aa  1628    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  61.49 
 
 
732 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  38.79 
 
 
395 aa  253  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 
878 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.64 
 
 
810 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  40.63 
 
 
681 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.79 
 
 
909 aa  231  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  38.8 
 
 
816 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 
685 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  33.25 
 
 
847 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  37.77 
 
 
362 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  42.97 
 
 
637 aa  200  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.41 
 
 
543 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  35.22 
 
 
865 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  35.31 
 
 
349 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
714 aa  187  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  31.18 
 
 
714 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.35 
 
 
632 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.21 
 
 
1676 aa  172  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
1276 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 
4489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.23 
 
 
1056 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
927 aa  163  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.87 
 
 
725 aa  162  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 
612 aa  158  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
1737 aa  157  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.46 
 
 
576 aa  156  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  35.04 
 
 
603 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.14 
 
 
1022 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
649 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
649 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.66 
 
 
818 aa  154  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  34.2 
 
 
739 aa  154  8e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  36.28 
 
 
1288 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.16 
 
 
784 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
646 aa  153  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
740 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.91 
 
 
988 aa  152  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
935 aa  150  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.62 
 
 
626 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.62 
 
 
614 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 
615 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.27 
 
 
626 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.27 
 
 
614 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 
614 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.89 
 
 
1694 aa  147  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.27 
 
 
614 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.95 
 
 
626 aa  147  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 
4079 aa  147  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 
1094 aa  146  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0419  hypothetical protein  57.85 
 
 
122 aa  145  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.831767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 
718 aa  145  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
612 aa  144  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
750 aa  144  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
608 aa  144  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  30.96 
 
 
766 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
465 aa  142  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 
614 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 
505 aa  140  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
955 aa  140  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3303  tetratricopeptide domain-containing protein  27.16 
 
 
1098 aa  140  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
620 aa  140  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.93 
 
 
620 aa  140  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
1406 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
828 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 
617 aa  139  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
562 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
639 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
635 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
635 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.96 
 
 
887 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
636 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  33.22 
 
 
602 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 
828 aa  138  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.08 
 
 
1056 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
611 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.38 
 
 
875 aa  135  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.3 
 
 
462 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 
486 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 
602 aa  135  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.83 
 
 
764 aa  135  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 
3145 aa  135  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.61 
 
 
2240 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 
824 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 
827 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
795 aa  133  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 
366 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.03 
 
 
573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
601 aa  132  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  36.27 
 
 
637 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
828 aa  129  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
3172 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.72 
 
 
397 aa  127  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  31.25 
 
 
703 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
686 aa  126  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
789 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  22.28 
 
 
2059 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
808 aa  125  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.53 
 
 
623 aa  125  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 
583 aa  124  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>