More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1093 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  71.81 
 
 
603 aa  787    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  75.53 
 
 
637 aa  1013    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
681 aa  1385    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  71.93 
 
 
583 aa  721    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  74.65 
 
 
685 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  69.38 
 
 
362 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  60.88 
 
 
612 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  70.7 
 
 
865 aa  489  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  65.49 
 
 
816 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  62.47 
 
 
909 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  38.37 
 
 
714 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  38.64 
 
 
714 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  59.62 
 
 
750 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  59.34 
 
 
739 aa  346  7e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
649 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
649 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
955 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.76 
 
 
646 aa  330  7e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 
3145 aa  327  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 
615 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.11 
 
 
620 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
662 aa  307  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 
935 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 
1450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.53 
 
 
626 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
636 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 
612 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
601 aa  300  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
602 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 
688 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 
1827 aa  295  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
639 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.26 
 
 
626 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
614 aa  293  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.26 
 
 
626 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.26 
 
 
614 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
614 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.26 
 
 
614 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
635 aa  291  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
635 aa  291  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
611 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
637 aa  287  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 
614 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 
740 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 
608 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 
653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  34.08 
 
 
653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
542 aa  273  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 
689 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  68.9 
 
 
430 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.51 
 
 
1677 aa  266  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  29.6 
 
 
703 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  26.93 
 
 
648 aa  263  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  48.62 
 
 
878 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
574 aa  259  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  32.66 
 
 
577 aa  258  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
578 aa  256  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
556 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  43.11 
 
 
764 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  48.52 
 
 
725 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.48 
 
 
810 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.22 
 
 
733 aa  247  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
1005 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.78 
 
 
1034 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
592 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  34.91 
 
 
473 aa  243  9e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 
767 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
636 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  32.53 
 
 
540 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  62.37 
 
 
235 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
523 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 
472 aa  234  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  42.63 
 
 
1676 aa  234  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  43.05 
 
 
622 aa  234  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.43 
 
 
1077 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  64.8 
 
 
437 aa  233  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  40.63 
 
 
795 aa  232  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
1038 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  37.57 
 
 
406 aa  231  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
747 aa  230  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  46.78 
 
 
1694 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  56.94 
 
 
435 aa  227  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
546 aa  226  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  58.33 
 
 
425 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.05 
 
 
632 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  40.95 
 
 
4489 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 
655 aa  220  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 
1094 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  55.84 
 
 
467 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  39.21 
 
 
3035 aa  219  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
438 aa  217  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  40.75 
 
 
505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
1451 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
1454 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  32.51 
 
 
872 aa  213  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  58.7 
 
 
514 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 
520 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
558 aa  211  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
529 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>