More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4127 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 655 aa  1296    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3799  TPR repeat-containing protein  38.42 
 
 		 691 aa  351  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 955 aa  246  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 681 aa  231  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 637 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  37.53 
 
 		 636 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 662 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  25.88 
 
 		 603 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 935 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 583 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 740 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  30.54 
 
 		 1677 aa  203  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.25 
 
 		 1450 aa  191  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  31.44 
 
 		 653 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 653 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 608 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.26 
 
 		 689 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 592 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 602 aa  180  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.98 
 
 		 620 aa  180  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 601 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29.45 
 
 		 714 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 747 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 714 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 767 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 578 aa  171  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 688 aa  170  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.86 
 
 		 626 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 542 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  28.18 
 
 		 648 aa  163  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 614 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 		 614 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 		 614 aa  160  7e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 		 626 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 		 614 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.22 
 
 		 626 aa  158  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 1038 aa  157  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  30.29 
 
 		 577 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 566 aa  155  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 523 aa  154  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1827 aa  154  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 620 aa  153  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 614 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 574 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 615 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 646 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0486  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 481 aa  150  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 780 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 558 aa  148  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 649 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 649 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 1005 aa  147  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 3145 aa  147  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.87 
 
 		 1034 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.09 
 
 		 760 aa  147  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  30.65 
 
 		 503 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 612 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1511  TPR domain-containing protein  28.33 
 
 		 525 aa  145  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000212111  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 556 aa  145  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 		 747 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 472 aa  144  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 639 aa  144  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.59 
 
 		 1077 aa  144  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  31.18 
 
 		 473 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  29.35 
 
 		 550 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 637 aa  140  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 545 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 412 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 545 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  31.86 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 505 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 611 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 635 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 635 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  28.08 
 
 		 703 aa  140  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 604 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.79 
 
 		 1764 aa  137  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 607 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 923 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2921  TPR repeat-containing protein  33.92 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  29.24 
 
 		 540 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 611 aa  135  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  27.77 
 
 		 1451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  27.77 
 
 		 1454 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0842  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 509 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  30.63 
 
 		 600 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0645  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 509 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0511  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 509 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.893562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1363  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 509 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.134471  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1752  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 		 509 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1567  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 509 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.085115  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 496 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1592  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0865529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  31.08 
 
 		 872 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 571 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>