More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_18211 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  64.99 
 
 
637 aa  846    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  64.64 
 
 
681 aa  859    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  62.89 
 
 
583 aa  767    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  100 
 
 
603 aa  1238    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  69.37 
 
 
865 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  67.73 
 
 
685 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  60.69 
 
 
362 aa  351  3e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  64.69 
 
 
612 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  59.29 
 
 
816 aa  344  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  53.64 
 
 
909 aa  341  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  35.48 
 
 
714 aa  336  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  56.48 
 
 
750 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 
714 aa  321  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  53.23 
 
 
739 aa  318  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  80.88 
 
 
430 aa  316  9e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
649 aa  290  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
649 aa  290  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 
646 aa  289  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
1450 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 
3145 aa  280  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 
955 aa  280  6e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  33.1 
 
 
1677 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
1827 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
601 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 
688 aa  278  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
602 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 
662 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 
615 aa  267  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30.76 
 
 
653 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 
653 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 
935 aa  262  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
620 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
542 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.25 
 
 
620 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  34.98 
 
 
473 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
578 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
608 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
636 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.55 
 
 
626 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 
612 aa  243  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
574 aa  242  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0104  TPR repeat-containing protein  36.56 
 
 
406 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.010788  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
639 aa  241  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.44 
 
 
1034 aa  241  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  32.92 
 
 
1005 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
546 aa  240  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
556 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.13 
 
 
614 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.13 
 
 
626 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  33.26 
 
 
472 aa  237  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
740 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
635 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 
635 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  29.5 
 
 
577 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 
614 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.88 
 
 
626 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.88 
 
 
614 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.88 
 
 
614 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
614 aa  233  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
520 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  24.96 
 
 
611 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
637 aa  230  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 
1038 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 
592 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  59.6 
 
 
437 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 
689 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  27.99 
 
 
703 aa  228  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  27.32 
 
 
648 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
636 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  29.17 
 
 
550 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  31.21 
 
 
540 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  55.67 
 
 
467 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  30.99 
 
 
872 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  51.02 
 
 
235 aa  213  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
438 aa  212  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.04 
 
 
733 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  51.89 
 
 
435 aa  210  7e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
1451 aa  210  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
1454 aa  209  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 
767 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  30.99 
 
 
502 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 
502 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 
502 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4127  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
655 aa  203  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal  0.206732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.42 
 
 
503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  27.95 
 
 
1077 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.85 
 
 
760 aa  197  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
558 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
529 aa  194  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
747 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  55.11 
 
 
514 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
527 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  43.4 
 
 
878 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  44.72 
 
 
594 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.61 
 
 
1764 aa  187  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  39.37 
 
 
875 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  25.45 
 
 
630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.8 
 
 
810 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
780 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>