More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_02811 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  100 
 
 
837 aa  1721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
811 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  64.51 
 
 
1676 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  55.52 
 
 
936 aa  327  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  53.97 
 
 
594 aa  303  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  27.03 
 
 
1014 aa  258  4e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 
909 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  30.02 
 
 
565 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
563 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.03 
 
 
816 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
1252 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
1252 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  38.84 
 
 
681 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  36.96 
 
 
865 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 
685 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.11 
 
 
864 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
362 aa  195  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
3035 aa  195  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
718 aa  194  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.97 
 
 
733 aa  193  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 
739 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
878 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 
1094 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 
637 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.94 
 
 
810 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  24 
 
 
789 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.15 
 
 
725 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
732 aa  177  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
3560 aa  177  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
754 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 
808 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
706 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 
750 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  25.23 
 
 
784 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  39.39 
 
 
612 aa  171  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
824 aa  171  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
730 aa  171  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  35.29 
 
 
603 aa  170  8e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 
754 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 
4489 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.74 
 
 
632 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 
3145 aa  160  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  23 
 
 
828 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 
505 aa  153  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
828 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  42.79 
 
 
583 aa  151  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.15 
 
 
1022 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 
1737 aa  147  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 
828 aa  147  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.81 
 
 
764 aa  147  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
927 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02771  hypothetical protein  43.37 
 
 
704 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.608629 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.95 
 
 
2240 aa  145  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
700 aa  144  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
649 aa  141  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
833 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.25 
 
 
1154 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.49 
 
 
818 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  26.05 
 
 
585 aa  140  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 
1085 aa  140  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  33.96 
 
 
780 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.13 
 
 
1694 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
392 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
597 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 
761 aa  139  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.09 
 
 
681 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.89 
 
 
784 aa  137  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.6 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
708 aa  135  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.7 
 
 
622 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16060  predicted protein  28.04 
 
 
494 aa  134  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 
750 aa  134  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
732 aa  134  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.24 
 
 
875 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.81 
 
 
887 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 
968 aa  131  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
796 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 
713 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 
612 aa  131  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  33.33 
 
 
594 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 
608 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.3 
 
 
1056 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  24.17 
 
 
715 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 
1056 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.01 
 
 
988 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 
689 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 
636 aa  128  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.51 
 
 
626 aa  127  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 
833 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.33 
 
 
1007 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  22.66 
 
 
708 aa  127  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 
3172 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
955 aa  125  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  29 
 
 
714 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 
448 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  23.7 
 
 
3301 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
847 aa  125  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
1827 aa  124  9e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.27 
 
 
543 aa  124  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 
523 aa  123  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>