More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2859 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1515    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 1252 aa  263  8e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 1252 aa  263  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.26 
 
 		 864 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  29.98 
 
 		 563 aa  256  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  34.63 
 
 		 1014 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 730 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.5 
 
 		 837 aa  187  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  29.08 
 
 		 565 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 811 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1094 aa  154  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 808 aa  146  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 3560 aa  145  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 3035 aa  144  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 4489 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 713 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  28.73 
 
 		 937 aa  127  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  24.71 
 
 		 790 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  29.11 
 
 		 560 aa  124  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  25.42 
 
 		 715 aa  122  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.59 
 
 		 790 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.83 
 
 		 585 aa  115  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 700 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1085 aa  115  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 672 aa  113  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.02 
 
 		 589 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 727 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1714 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 633 aa  109  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 647 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  20.36 
 
 		 632 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  28.6 
 
 		 574 aa  108  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 740 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  29.64 
 
 		 699 aa  107  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.14 
 
 		 529 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  25.87 
 
 		 719 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 717 aa  103  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 779 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 717 aa  101  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  30.52 
 
 		 637 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 739 aa  99.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 780 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  27.3 
 
 		 780 aa  99.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.8 
 
 		 816 aa  99  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 		 1106 aa  98.2  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 611 aa  97.8  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  26.4 
 
 		 921 aa  97.8  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.47 
 
 		 589 aa  97.4  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 		 570 aa  96.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 569 aa  95.9  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1106 aa  95.1  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  26.39 
 
 		 624 aa  94.7  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.61 
 
 		 739 aa  95.1  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  27.35 
 
 		 657 aa  94.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 647 aa  94.4  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 633 aa  93.6  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 590 aa  93.2  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  27.35 
 
 		 657 aa  93.2  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  22.21 
 
 		 708 aa  92.8  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  31.83 
 
 		 590 aa  92.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  25.77 
 
 		 797 aa  92.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  25.82 
 
 		 566 aa  92.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16060  predicted protein  26.18 
 
 		 494 aa  92  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 968 aa  92  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  26.51 
 
 		 630 aa  91.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 616 aa  91.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 909 aa  91.3  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 706 aa  90.9  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 627 aa  90.1  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2920  hypothetical protein  34.85 
 
 		 696 aa  90.1  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  26.32 
 
 		 1221 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  26.06 
 
 		 1116 aa  89  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 750 aa  88.6  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  24.55 
 
 		 781 aa  88.6  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 		 723 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  27.16 
 
 		 596 aa  88.6  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 739 aa  88.2  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 732 aa  88.6  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 667 aa  88.2  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  23.43 
 
 		 821 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  32.33 
 
 		 568 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  23.27 
 
 		 821 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 776 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.93 
 
 		 742 aa  85.9  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 1143 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  24.85 
 
 		 747 aa  85.9  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 2490 aa  85.5  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  23.43 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  23.43 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  23.43 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  27.98 
 
 		 745 aa  85.1  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3323  hypothetical protein  25.61 
 
 		 617 aa  84.7  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.59937  normal  0.0609726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3311  putative accessory processing protein  25.61 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 776 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 732 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  25.07 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  25.07 
 
 		 731 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3173  hypothetical protein  25.3 
 
 		 617 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 718 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  28.25 
 
 		 632 aa  83.2  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>