83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3323 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3173  hypothetical protein  99.19 
 
 		 617 aa  1274    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3323  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1283    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.59937  normal  0.0609726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3311  putative accessory processing protein  99.51 
 
 		 617 aa  1278    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0002  hypothetical protein  49.44 
 
 		 636 aa  598  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000524095  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1440  putative accessory processing protein  43.53 
 
 		 624 aa  485  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542915  normal  0.139201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2679  putative accessory processing protein  42.43 
 
 		 624 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2192  putative adhesin processing HmwC-like protein  39.9 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109461  normal  0.294129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0723  putative adhesin processing HmwC-like protein  38.42 
 
 		 632 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204322  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4404  putative adhesin processing HmwC-like protein  39.19 
 
 		 613 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.23 
 
 		 837 aa  89.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 864 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  24.54 
 
 		 784 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 811 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  26.98 
 
 		 1014 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  23.34 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 796 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 		 1252 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 		 1252 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  26.73 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 4489 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 3560 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  20.35 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 672 aa  63.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 647 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 		 616 aa  62  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1094 aa  61.6  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 3035 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.42 
 
 		 1106 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 574 aa  60.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 789 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 1714 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  23.51 
 
 		 2490 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  26.54 
 
 		 560 aa  58.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 761 aa  58.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  24.92 
 
 		 699 aa  58.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 1085 aa  58.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 626 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 808 aa  57.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 569 aa  56.6  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 		 660 aa  57  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 611 aa  55.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  23.17 
 
 		 568 aa  55.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 968 aa  55.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1106 aa  54.7  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 740 aa  54.3  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 754 aa  54.3  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 789 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 654 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 754 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  25.1 
 
 		 937 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  23.77 
 
 		 657 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  24.61 
 
 		 566 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  25.17 
 
 		 790 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  22.71 
 
 		 624 aa  51.6  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.2 
 
 		 723 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 717 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 647 aa  49.7  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 717 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 727 aa  50.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 739 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  23.69 
 
 		 797 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 627 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4222  glycosyltransferase TPR domain-containing protein  22.18 
 
 		 594 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 		 790 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 734 aa  48.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 667 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.36 
 
 		 570 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  21.83 
 
 		 637 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  21.49 
 
 		 633 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.58 
 
 		 589 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  21.91 
 
 		 596 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  22.42 
 
 		 657 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.63 
 
 		 667 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.99 
 
 		 589 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  20.3 
 
 		 633 aa  45.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 974 aa  45.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  22.75 
 
 		 708 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 732 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 828 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  24.74 
 
 		 781 aa  43.9  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 708 aa  43.9  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>