51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_F0002 on replicon NC_009786
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009786  EcE24377A_F0002  hypothetical protein  100 
 
 		 636 aa  1312    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000524095  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3323  hypothetical protein  49.44 
 
 		 617 aa  586  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.59937  normal  0.0609726 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3173  hypothetical protein  49.44 
 
 		 617 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3311  putative accessory processing protein  49.44 
 
 		 617 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1440  putative accessory processing protein  40.22 
 
 		 624 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542915  normal  0.139201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2679  putative accessory processing protein  39.62 
 
 		 624 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0723  putative adhesin processing HmwC-like protein  39.16 
 
 		 632 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204322  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4404  putative adhesin processing HmwC-like protein  38.97 
 
 		 613 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2192  putative adhesin processing HmwC-like protein  37.44 
 
 		 637 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109461  normal  0.294129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  28.73 
 
 		 837 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  25.56 
 
 		 784 aa  73.9  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  26.39 
 
 		 1014 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 563 aa  64.3  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 811 aa  63.9  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 4489 aa  63.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.14 
 
 		 864 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1714 aa  60.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  20.79 
 
 		 1252 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  20.79 
 
 		 1252 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 3560 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 3035 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  23.88 
 
 		 566 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 968 aa  53.9  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 717 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 1094 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 789 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  23.13 
 
 		 657 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 717 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  25 
 
 		 585 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 706 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 796 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  22.86 
 
 		 657 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 632 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  21.63 
 
 		 630 aa  48.5  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  27.93 
 
 		 633 aa  48.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 633 aa  47.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  25.54 
 
 		 452 aa  47.8  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  23.57 
 
 		 565 aa  47.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  21.65 
 
 		 624 aa  47  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 672 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 574 aa  47.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  21.74 
 
 		 582 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  24.39 
 
 		 560 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  20.77 
 
 		 616 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  20.51 
 
 		 2490 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 789 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 		 654 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 		 723 aa  44.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  24.23 
 
 		 395 aa  44.3  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 761 aa  43.9  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 1085 aa  43.9  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>