More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0709 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 864 aa  1771    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  42.54 
 
 		 1014 aa  504  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  43.64 
 
 		 563 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 		 1252 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  36.56 
 
 		 1252 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  31.94 
 
 		 565 aa  279  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  34.03 
 
 		 784 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 730 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 811 aa  200  9e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.11 
 
 		 837 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2404  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  42.74 
 
 		 457 aa  184  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  31.11 
 
 		 731 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 2490 aa  153  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 739 aa  152  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  30.83 
 
 		 731 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  29.25 
 
 		 719 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  30.33 
 
 		 740 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  29.92 
 
 		 747 aa  145  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 		 745 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 706 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  24.65 
 
 		 585 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 738 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 1007 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 739 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 968 aa  132  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 616 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  23.11 
 
 		 699 aa  127  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 808 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 1714 aa  127  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.8 
 
 		 1154 aa  127  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.41 
 
 		 589 aa  126  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  25.25 
 
 		 1221 aa  125  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 700 aa  125  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 3035 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 727 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 909 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 750 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.54 
 
 		 1106 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.04 
 
 		 816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.43 
 
 		 529 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 611 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 647 aa  116  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1106 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 633 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  23.01 
 
 		 1116 aa  113  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 3560 aa  111  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 779 aa  111  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 739 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  22.24 
 
 		 693 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 632 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 750 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.53 
 
 		 739 aa  107  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  22.39 
 
 		 708 aa  107  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.54 
 
 		 739 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  22.29 
 
 		 937 aa  106  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  20.3 
 
 		 654 aa  105  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  21.97 
 
 		 718 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 713 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  27.49 
 
 		 921 aa  102  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.56 
 
 		 589 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 761 aa  102  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 633 aa  102  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 		 667 aa  101  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 		 1085 aa  101  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 4489 aa  100  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  21.67 
 
 		 715 aa  98.2  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 672 aa  97.4  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  23.77 
 
 		 780 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 780 aa  97.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  20.75 
 
 		 627 aa  95.9  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  21.82 
 
 		 1415 aa  95.9  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 598 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 		 717 aa  95.1  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.73 
 
 		 740 aa  94.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  21.8 
 
 		 717 aa  94  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16060  predicted protein  22.98 
 
 		 494 aa  93.2  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  21.21 
 
 		 619 aa  93.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.37 
 
 		 739 aa  92.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2920  hypothetical protein  26.09 
 
 		 696 aa  92  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  24.66 
 
 		 633 aa  91.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.07 
 
 		 1094 aa  91.7  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 733 aa  92  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 		 789 aa  91.7  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  22.97 
 
 		 781 aa  91.3  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  21.44 
 
 		 574 aa  90.9  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 		 626 aa  90.9  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 828 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 734 aa  90.1  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  26.91 
 
 		 1143 aa  89.7  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 789 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 828 aa  89.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 974 aa  89  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  21.65 
 
 		 732 aa  87.8  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  20.34 
 
 		 754 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 822 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  20.86 
 
 		 740 aa  85.9  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  22.58 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  23.24 
 
 		 637 aa  85.5  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 595 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  21.16 
 
 		 828 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>