More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3958 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 811 aa  1649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  33.42 
 
 		 837 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 1252 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 1252 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 563 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  26.26 
 
 		 1014 aa  247  6e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  31.31 
 
 		 565 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 		 864 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.61 
 
 		 816 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 4489 aa  178  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 779 aa  174  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 909 aa  174  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 3035 aa  173  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 		 828 aa  173  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  28.39 
 
 		 784 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 790 aa  168  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  26.81 
 
 		 781 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  25.61 
 
 		 790 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 718 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 		 1094 aa  165  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 780 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  25.71 
 
 		 780 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 824 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2920  hypothetical protein  30.12 
 
 		 696 aa  162  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1085 aa  162  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 789 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 730 aa  158  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 808 aa  154  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  31.56 
 
 		 821 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 776 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 		 776 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16060  predicted protein  29.74 
 
 		 494 aa  152  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  24.81 
 
 		 776 aa  151  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  24.81 
 
 		 776 aa  151  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  24.81 
 
 		 776 aa  151  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  24.81 
 
 		 821 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 750 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  22.11 
 
 		 739 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 667 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 3560 aa  145  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 828 aa  144  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  25.42 
 
 		 797 aa  141  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 706 aa  141  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.98 
 
 		 810 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 732 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 833 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  25.92 
 
 		 833 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 654 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 750 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 878 aa  134  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.55 
 
 		 632 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 828 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 713 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 754 aa  132  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 708 aa  131  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  24.73 
 
 		 699 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  34.76 
 
 		 864 aa  128  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  22.51 
 
 		 1154 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  27.86 
 
 		 585 aa  128  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 681 aa  127  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.04 
 
 		 505 aa  127  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.67 
 
 		 725 aa  126  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 750 aa  124  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 685 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 754 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 717 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 2490 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 740 aa  116  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 717 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 727 aa  116  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 611 aa  115  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  31.95 
 
 		 603 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 761 aa  114  7.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 732 aa  114  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 616 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.5 
 
 		 1106 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.32 
 
 		 739 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 627 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  19.14 
 
 		 632 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.86 
 
 		 865 aa  112  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  25.75 
 
 		 719 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.78 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 362 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 739 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  26.17 
 
 		 1221 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.69 
 
 		 589 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 529 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 693 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 602 aa  108  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 637 aa  108  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.78 
 
 		 725 aa  107  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 739 aa  107  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 608 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 		 1737 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 		 968 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 723 aa  105  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  27.99 
 
 		 620 aa  104  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 734 aa  103  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>