219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0755 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 730 aa  1475    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 563 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  26.88 
 
 		 1014 aa  261  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.64 
 
 		 864 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 1252 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 1252 aa  220  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  37.77 
 
 		 784 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.35 
 
 		 837 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  27.82 
 
 		 565 aa  180  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 811 aa  171  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2920  hypothetical protein  32.45 
 
 		 696 aa  164  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  27.68 
 
 		 699 aa  151  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 700 aa  127  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 706 aa  120  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 654 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  25.8 
 
 		 719 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 1007 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 1116 aa  108  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1085 aa  108  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 808 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 4489 aa  107  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 968 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  29.1 
 
 		 560 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  24.42 
 
 		 715 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.64 
 
 		 740 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 713 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16060  predicted protein  26.23 
 
 		 494 aa  98.6  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.83 
 
 		 739 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 761 aa  97.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  30.45 
 
 		 727 aa  97.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 660 aa  93.6  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.39 
 
 		 529 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  22.24 
 
 		 3560 aa  93.2  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 779 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 672 aa  92.8  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  29.96 
 
 		 568 aa  92  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 616 aa  91.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1094 aa  90.9  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 570 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.12 
 
 		 589 aa  90.5  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  23.68 
 
 		 2490 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 3035 aa  89.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 739 aa  89  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20301  hypothetical protein  25.45 
 
 		 395 aa  88.2  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.236649 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 632 aa  88.2  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.44 
 
 		 1106 aa  88.2  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  25.84 
 
 		 680 aa  87.4  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  25.81 
 
 		 585 aa  87.4  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 750 aa  87.4  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 909 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  28.03 
 
 		 780 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 780 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 569 aa  85.5  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 740 aa  84.7  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 739 aa  84.7  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1106 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 739 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  24.79 
 
 		 745 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 647 aa  83.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 647 aa  82.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1714 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3853  O-linked acetylglucosamine transferase  30.52 
 
 		 590 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 717 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 717 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  27.35 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 627 aa  81.6  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  26.76 
 
 		 731 aa  81.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  23.49 
 
 		 747 aa  81.3  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.66 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  26.47 
 
 		 797 aa  80.9  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4069  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 590 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00017793  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  26.47 
 
 		 731 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 789 aa  79.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  26.43 
 
 		 633 aa  79.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 828 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.01 
 
 		 816 aa  79  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 626 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  27.07 
 
 		 921 aa  77.4  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 633 aa  77.4  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 574 aa  77  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  31.23 
 
 		 588 aa  76.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  27.19 
 
 		 1415 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  27.66 
 
 		 630 aa  75.5  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 633 aa  75.1  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  28.31 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  28.85 
 
 		 1221 aa  74.7  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 618 aa  73.9  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  23.4 
 
 		 740 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 828 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1319  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000490816  hitchhiker  8.5993e-22 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 796 aa  72.4  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 734 aa  72  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  28.37 
 
 		 596 aa  72  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 828 aa  72  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 		 790 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  27.07 
 
 		 492 aa  72  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  24.76 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 		 1143 aa  71.2  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 589 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.73 
 
 		 742 aa  70.5  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>