More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2167 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  60.92 
 
 
563 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
1014 aa  2087    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.54 
 
 
864 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 
1252 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 
1252 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  30.88 
 
 
565 aa  288  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.03 
 
 
837 aa  258  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 
811 aa  242  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0755  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
730 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548835  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  34.2 
 
 
784 aa  231  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
808 aa  197  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
1085 aa  189  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 
706 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
3035 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 
909 aa  179  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.07 
 
 
3560 aa  171  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
700 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.84 
 
 
816 aa  167  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 
828 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 
1094 aa  157  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
750 aa  156  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 
828 aa  154  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 
4489 aa  153  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2404  Prolyl 4-hydroxylase alpha subunit  36.21 
 
 
457 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 
740 aa  151  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 
824 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 
718 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
754 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  21.07 
 
 
754 aa  149  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.07 
 
 
1154 aa  148  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 
739 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  22.15 
 
 
715 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 
789 aa  144  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 
750 aa  144  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
739 aa  140  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  21.59 
 
 
732 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.03 
 
 
739 aa  140  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 
589 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.8 
 
 
1106 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 
713 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 
828 aa  137  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  25.37 
 
 
2490 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23 
 
 
968 aa  136  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0256  hypothetical protein  28.28 
 
 
719 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 
739 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 
616 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 
1106 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  20.74 
 
 
833 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
633 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
878 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 
833 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.97 
 
 
529 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  27.3 
 
 
745 aa  128  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.45 
 
 
810 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
727 aa  125  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  25.29 
 
 
740 aa  125  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 
627 aa  125  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 
708 aa  125  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 
654 aa  124  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  28.23 
 
 
747 aa  124  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  20.36 
 
 
708 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  25.06 
 
 
1007 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 
761 aa  120  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  27.76 
 
 
731 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 
632 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  27.49 
 
 
731 aa  119  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.29 
 
 
739 aa  118  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
1714 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 
667 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  19.73 
 
 
717 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 
632 aa  117  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  20.33 
 
 
937 aa  115  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.12 
 
 
1694 aa  115  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 
738 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2920  hypothetical protein  28.76 
 
 
696 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.98 
 
 
589 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  25.33 
 
 
459 aa  112  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16060  predicted protein  28.3 
 
 
494 aa  111  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  19.08 
 
 
717 aa  111  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  29.62 
 
 
921 aa  110  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  25.46 
 
 
452 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.57 
 
 
1737 aa  110  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.97 
 
 
784 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
672 aa  108  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.97 
 
 
818 aa  107  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
3145 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
685 aa  106  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 
543 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  26.83 
 
 
492 aa  106  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  20.05 
 
 
699 aa  106  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 
734 aa  104  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 
647 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.6 
 
 
764 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 
618 aa  102  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.61 
 
 
667 aa  102  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.36 
 
 
462 aa  101  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
633 aa  101  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
681 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.29 
 
 
622 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 
733 aa  100  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>