98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2679 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1440  putative accessory processing protein  89.57 
 
 		 624 aa  1139    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542915  normal  0.139201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2679  putative accessory processing protein  100 
 
 		 624 aa  1284    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0723  putative adhesin processing HmwC-like protein  50.57 
 
 		 632 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204322  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4404  putative adhesin processing HmwC-like protein  50.82 
 
 		 613 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2192  putative adhesin processing HmwC-like protein  48.64 
 
 		 637 aa  569  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109461  normal  0.294129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3311  putative accessory processing protein  42.34 
 
 		 617 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3173  hypothetical protein  42.17 
 
 		 617 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3323  hypothetical protein  42.43 
 
 		 617 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.59937  normal  0.0609726 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0002  hypothetical protein  39.62 
 
 		 636 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000524095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 811 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.82 
 
 		 837 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 4489 aa  70.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1085 aa  67.4  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  24.6 
 
 		 560 aa  64.7  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 3560 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  21.39 
 
 		 2490 aa  64.3  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 754 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  21.05 
 
 		 1252 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  21.05 
 
 		 1252 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 616 aa  62  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 569 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 627 aa  62  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 654 aa  62  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 717 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 754 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 708 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 647 aa  60.5  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  27.37 
 
 		 568 aa  60.1  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 595 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 1714 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 717 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 		 3035 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 672 aa  58.9  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.1 
 
 		 864 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 1094 aa  58.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  23.93 
 
 		 699 aa  57  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  26.62 
 
 		 633 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  24.53 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  24.16 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.51 
 
 		 667 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  25.08 
 
 		 588 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 574 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 828 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.31 
 
 		 589 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 611 aa  55.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 828 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  25.51 
 
 		 585 aa  54.7  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 633 aa  54.7  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 968 aa  54.7  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 667 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 789 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  24.56 
 
 		 459 aa  53.9  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 706 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 632 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 833 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 		 761 aa  53.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  24.7 
 
 		 492 aa  52.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.37 
 
 		 589 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 633 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  27.13 
 
 		 937 aa  53.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 789 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  25.09 
 
 		 1014 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 626 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 796 aa  52.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  21.38 
 
 		 565 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.29 
 
 		 570 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  24.38 
 
 		 1143 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 833 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 619 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  25.79 
 
 		 452 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 598 aa  50.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0113  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.13 
 
 		 726 aa  50.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0423432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 718 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2410  hypothetical protein  21.37 
 
 		 624 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  23.11 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 713 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 727 aa  48.9  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 740 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 732 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  24.92 
 
 		 596 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  32.22 
 
 		 630 aa  48.5  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 647 aa  48.1  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 779 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 808 aa  47.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  22.45 
 
 		 552 aa  47.4  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 700 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.29 
 
 		 723 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  24.12 
 
 		 797 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 660 aa  47  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 732 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 776 aa  44.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  23.11 
 
 		 790 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  21.83 
 
 		 821 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.48 
 
 		 1106 aa  44.3  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 776 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  27.78 
 
 		 680 aa  43.9  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  22.4 
 
 		 657 aa  43.9  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>