153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0113 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0113  O-linked N-acetylglucosamine transferase  100 
 
 		 726 aa  1486    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0423432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 633 aa  211  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 754 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 833 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 754 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.44 
 
 		 589 aa  190  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 833 aa  187  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.55 
 
 		 589 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 598 aa  183  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 619 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 828 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0114  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 724 aa  178  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.029745  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 732 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 595 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 626 aa  171  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 708 aa  170  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.62 
 
 		 667 aa  170  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 		 828 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.79 
 
 		 828 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 968 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.08 
 
 		 1106 aa  165  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 1714 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  32.88 
 
 		 937 aa  163  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 718 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 789 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 789 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  31.91 
 
 		 596 aa  157  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0359  hypothetical protein  28.12 
 
 		 657 aa  157  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.224796  normal  0.0716049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 633 aa  157  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  30.85 
 
 		 585 aa  157  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 824 aa  156  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1106 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0327  hypothetical protein  31.44 
 
 		 657 aa  152  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.322162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 713 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.61 
 
 		 529 aa  148  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 717 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 717 aa  146  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 734 aa  144  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  28.77 
 
 		 1221 aa  143  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  26.91 
 
 		 633 aa  143  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 727 aa  141  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.93 
 
 		 723 aa  140  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 909 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 3035 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 796 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  28.57 
 
 		 921 aa  139  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.73 
 
 		 816 aa  137  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 822 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 3560 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  27.25 
 
 		 708 aa  137  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 647 aa  136  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 1094 aa  135  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  27.49 
 
 		 747 aa  134  6.999999999999999e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 750 aa  133  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 616 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 740 aa  133  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 667 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 632 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  25.71 
 
 		 630 aa  131  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  27.75 
 
 		 560 aa  130  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  29.47 
 
 		 797 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  29.41 
 
 		 588 aa  130  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2639  tetratricopeptide TPR_2  27.37 
 
 		 552 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 4489 aa  128  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.29 
 
 		 740 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 733 aa  127  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2394  hypothetical protein  26.89 
 
 		 740 aa  127  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000509541  hitchhiker  0.0000624153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  26.84 
 
 		 1143 aa  127  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  28.57 
 
 		 731 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  26.75 
 
 		 1415 aa  126  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.18 
 
 		 715 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 611 aa  126  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 574 aa  125  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 776 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  30.72 
 
 		 776 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  30.72 
 
 		 776 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 776 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  30.72 
 
 		 776 aa  124  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  28.2 
 
 		 731 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  30.69 
 
 		 699 aa  124  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.95 
 
 		 739 aa  124  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  30.72 
 
 		 821 aa  124  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.06 
 
 		 742 aa  124  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  30.72 
 
 		 821 aa  123  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  26.22 
 
 		 492 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  30.91 
 
 		 781 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 739 aa  122  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  30.39 
 
 		 566 aa  121  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 654 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  28.78 
 
 		 1116 aa  121  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  25.87 
 
 		 637 aa  120  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0934  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 739 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.897718 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  27.85 
 
 		 582 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 618 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 		 672 aa  118  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.1 
 
 		 739 aa  117  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 706 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  31 
 
 		 632 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  23.62 
 
 		 568 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>