109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4404 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0723  putative adhesin processing HmwC-like protein  87.01 
 
 		 632 aa  1111    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204322  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2192  putative adhesin processing HmwC-like protein  65.12 
 
 		 637 aa  833    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109461  normal  0.294129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4404  putative adhesin processing HmwC-like protein  100 
 
 		 613 aa  1274    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1440  putative accessory processing protein  50.41 
 
 		 624 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542915  normal  0.139201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2679  putative accessory processing protein  50.82 
 
 		 624 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0002  hypothetical protein  38.97 
 
 		 636 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000524095  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3173  hypothetical protein  39.41 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3323  hypothetical protein  39.19 
 
 		 617 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.59937  normal  0.0609726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3311  putative accessory processing protein  39.35 
 
 		 617 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.98 
 
 		 837 aa  90.9  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  26.03 
 
 		 560 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 789 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 811 aa  75.1  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1085 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 754 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 4489 aa  70.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  21.91 
 
 		 3560 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1714 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  26.7 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 3035 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 789 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  23.57 
 
 		 566 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 667 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 717 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  23.61 
 
 		 699 aa  63.9  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 717 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 627 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  24.43 
 
 		 780 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 780 aa  62  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 708 aa  62  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 		 667 aa  62  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  22.76 
 
 		 633 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 616 aa  61.2  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 828 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  25.46 
 
 		 568 aa  60.5  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 828 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 654 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 779 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1094 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  21.27 
 
 		 1116 aa  57.8  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.83 
 
 		 723 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 595 aa  57  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 706 aa  57  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.66 
 
 		 1106 aa  57  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  24.21 
 
 		 596 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 		 570 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 740 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.57 
 
 		 864 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 796 aa  55.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 589 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 833 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 824 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 619 aa  55.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 611 aa  54.3  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 833 aa  54.3  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  19.79 
 
 		 1252 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 693 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.07 
 
 		 739 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.91 
 
 		 589 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  19.79 
 
 		 1252 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  24.15 
 
 		 565 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 		 618 aa  52.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 598 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  20.92 
 
 		 630 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  22.47 
 
 		 715 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  21.27 
 
 		 632 aa  50.8  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 974 aa  50.8  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 713 aa  50.4  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  22.66 
 
 		 588 aa  50.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  21.25 
 
 		 784 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 808 aa  50.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2411  hypothetical protein  21.8 
 
 		 582 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100681  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.1 
 
 		 793 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 732 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  22.92 
 
 		 797 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  23.8 
 
 		 1014 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1106 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.61 
 
 		 529 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  22.55 
 
 		 680 aa  49.3  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  22.33 
 
 		 790 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 633 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  24.9 
 
 		 459 aa  48.9  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  21.58 
 
 		 708 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  21.37 
 
 		 968 aa  47.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 700 aa  47.4  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 909 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  20.18 
 
 		 2490 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.32 
 
 		 790 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1086  hypothetical protein  23.2 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1161  hypothetical protein  23.24 
 
 		 637 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.143311  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 750 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>