110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2192 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0723  putative adhesin processing HmwC-like protein  66.4 
 
 		 632 aa  854    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.204322  normal  0.533271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2192  putative adhesin processing HmwC-like protein  100 
 
 		 637 aa  1314    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109461  normal  0.294129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4404  putative adhesin processing HmwC-like protein  65.12 
 
 		 613 aa  847    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1440  putative accessory processing protein  49.37 
 
 		 624 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.542915  normal  0.139201 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2679  putative accessory processing protein  48.64 
 
 		 624 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3173  hypothetical protein  39.75 
 
 		 617 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3323  hypothetical protein  39.9 
 
 		 617 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.59937  normal  0.0609726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3311  putative accessory processing protein  39.75 
 
 		 617 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0002  hypothetical protein  37.44 
 
 		 636 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000524095  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  25.33 
 
 		 811 aa  88.6  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  27.14 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  24.58 
 
 		 837 aa  73.9  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 1085 aa  71.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 3560 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 626 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 4489 aa  70.5  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 828 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 754 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 3035 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 828 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  26.24 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 754 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  20.8 
 
 		 761 aa  65.1  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  20.2 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 667 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 616 aa  64.3  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 833 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  26.84 
 
 		 1415 aa  63.9  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 833 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 789 aa  62.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  22.26 
 
 		 699 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 1714 aa  61.2  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 732 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 828 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0699  FkbM family methyltransferase  23.04 
 
 		 921 aa  60.5  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1088  hypothetical protein  24.05 
 
 		 566 aa  60.8  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 598 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 1094 aa  60.1  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0348  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.216855  decreased coverage  0.00958266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  25.31 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 727 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 654 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04549  tetratricopeptide repeat domain protein  25.37 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 589 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  21.12 
 
 		 1116 aa  56.2  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2579  hypothetical protein  24.03 
 
 		 588 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385383  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 796 aa  55.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 706 aa  55.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.38 
 
 		 1106 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0220  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 779 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.52 
 
 		 864 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 740 aa  54.3  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  22.34 
 
 		 633 aa  53.9  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  20.63 
 
 		 2490 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.62 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 824 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 595 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2859  hypothetical protein  24.2 
 
 		 784 aa  52.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.261174  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  23.43 
 
 		 708 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 647 aa  51.6  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.87 
 
 		 667 aa  51.2  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.94 
 
 		 589 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 1252 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 569 aa  51.2  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 1252 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  36.59 
 
 		 1014 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 574 aa  50.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  20.93 
 
 		 717 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 633 aa  50.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1891  hypothetical protein  21.77 
 
 		 492 aa  50.8  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.591473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  22.13 
 
 		 1144 aa  49.7  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 822 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  24.37 
 
 		 1221 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  23.55 
 
 		 459 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 		 808 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.97 
 
 		 570 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  21.32 
 
 		 717 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  21.09 
 
 		 750 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  21.29 
 
 		 780 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 780 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4080  TPR repeat-containing SPINDLY family protein  24.7 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  22.53 
 
 		 797 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 647 aa  48.9  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  21.22 
 
 		 1143 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 611 aa  48.5  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  22.19 
 
 		 732 aa  48.1  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  19.69 
 
 		 790 aa  47.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 693 aa  47.4  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  19.28 
 
 		 739 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.62 
 
 		 723 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  20.97 
 
 		 1106 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  22.4 
 
 		 630 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  25.6 
 
 		 937 aa  46.2  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  21.71 
 
 		 781 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 660 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7846  hypothetical protein  22.12 
 
 		 452 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346388 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  21.37 
 
 		 734 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>