More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8213 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 392 aa  770    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  48.88 
 
 		 1022 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  49.4 
 
 		 988 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  49.29 
 
 		 818 aa  330  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  49.29 
 
 		 784 aa  325  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  46.72 
 
 		 1056 aa  324  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  46.46 
 
 		 1056 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  45.24 
 
 		 649 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  40.79 
 
 		 706 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  40.23 
 
 		 706 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  40.24 
 
 		 462 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.31 
 
 		 839 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 605 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.04 
 
 		 778 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.75 
 
 		 746 aa  202  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  43.05 
 
 		 820 aa  199  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.82 
 
 		 878 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  38 
 
 		 334 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.91 
 
 		 810 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 927 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 1421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.31 
 
 		 738 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  40.57 
 
 		 750 aa  181  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.86 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  41.3 
 
 		 581 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 1276 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  39.25 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 617 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  40.84 
 
 		 582 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  38.46 
 
 		 539 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 371 aa  169  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.94 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.08 
 
 		 542 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.12 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.12 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.57 
 
 		 1694 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  38.87 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2723  TPR repeat-containing protein  37.85 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26129  normal  0.431849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 450 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.65 
 
 		 632 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 556 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 		 425 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.7 
 
 		 707 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.99 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 3560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3056  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 		 543 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1676 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 4489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.7 
 
 		 629 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 543 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 3035 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.28 
 
 		 458 aa  149  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 562 aa  149  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 279 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 4079 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1827 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7275  hypothetical protein  32.03 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1773  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 318 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 		 594 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 515 aa  143  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  31.7 
 
 		 833 aa  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  38.43 
 
 		 352 aa  142  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  31.49 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  30.11 
 
 		 369 aa  141  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 847 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 547 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.07 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 446 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.15 
 
 		 837 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1094 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.63 
 
 		 573 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.48 
 
 		 261 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  41.97 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.02 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.97 
 
 		 730 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 		 740 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 1737 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1392  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 687 aa  133  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  38.43 
 
 		 286 aa  133  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.43 
 
 		 286 aa  133  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  37.02 
 
 		 289 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  30.59 
 
 		 1007 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 804 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 301 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.62 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  39.15 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>