More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1870 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 686 aa  1393    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.66 
 
 		 576 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.88 
 
 		 641 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  37.8 
 
 		 686 aa  392  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  35.46 
 
 		 643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  34.24 
 
 		 776 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 589 aa  296  9e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 		 593 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  36.06 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 645 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 879 aa  186  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 762 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.65 
 
 		 810 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 715 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 795 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  39.04 
 
 		 878 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  31.04 
 
 		 546 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  39.57 
 
 		 685 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 748 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.4 
 
 		 632 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 		 3145 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 648 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 362 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 		 681 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 847 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 790 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 909 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  42.41 
 
 		 714 aa  145  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  39.84 
 
 		 714 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  34.12 
 
 		 816 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 626 aa  142  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  34.45 
 
 		 795 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 827 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  39.59 
 
 		 637 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.53 
 
 		 626 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.53 
 
 		 626 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.53 
 
 		 614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.53 
 
 		 614 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 		 614 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  32.49 
 
 		 725 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 792 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  36.49 
 
 		 764 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 		 536 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 594 aa  134  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  35 
 
 		 603 aa  133  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 718 aa  130  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.85 
 
 		 875 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  34.78 
 
 		 865 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  32.55 
 
 		 622 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  33.78 
 
 		 732 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 744 aa  127  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 573 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.89 
 
 		 784 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.65 
 
 		 818 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1276 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  40.45 
 
 		 340 aa  124  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  34 
 
 		 620 aa  124  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 739 aa  124  7e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 646 aa  124  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 750 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.23 
 
 		 689 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 649 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.28 
 
 		 820 aa  123  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 		 649 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 620 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 4489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 		 615 aa  122  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 		 1737 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 639 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.88 
 
 		 1056 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.37 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 988 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 766 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 1406 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 612 aa  119  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 3035 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  32.96 
 
 		 374 aa  119  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 979 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.93 
 
 		 1022 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 808 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 824 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  38.86 
 
 		 1450 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 1486 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 3172 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 3301 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.01 
 
 		 1694 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 611 aa  114  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 635 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 635 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 4079 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  26.58 
 
 		 559 aa  112  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>