More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1432 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 573 aa  1152    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  62.48 
 
 		 573 aa  736    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  71.9 
 
 		 573 aa  873    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.9 
 
 		 572 aa  621  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.72 
 
 		 572 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  50.53 
 
 		 568 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.76 
 
 		 566 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 567 aa  297  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 594 aa  244  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 594 aa  222  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 563 aa  191  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  29.24 
 
 		 632 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1676 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.21 
 
 		 557 aa  160  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 565 aa  160  8e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 722 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 		 599 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 878 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 638 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.1 
 
 		 2240 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.54 
 
 		 581 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 1737 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 566 aa  144  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 562 aa  143  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.51 
 
 		 603 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.69 
 
 		 553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.95 
 
 		 810 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 884 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.11 
 
 		 1694 aa  135  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 622 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  25.71 
 
 		 621 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 610 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 		 610 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  25.71 
 
 		 621 aa  130  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  31.71 
 
 		 619 aa  128  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  29.57 
 
 		 584 aa  127  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 607 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 621 aa  126  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  24.72 
 
 		 583 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  35.58 
 
 		 677 aa  126  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  31.28 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.06 
 
 		 619 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  26.16 
 
 		 562 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 1276 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  25.17 
 
 		 573 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 4079 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  25.19 
 
 		 593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 750 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 		 633 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.19 
 
 		 745 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  33.18 
 
 		 593 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  25.81 
 
 		 586 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 617 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.8 
 
 		 548 aa  118  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 631 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.21 
 
 		 758 aa  117  5e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.58 
 
 		 633 aa  117  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  26.66 
 
 		 595 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 582 aa  117  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 617 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 		 425 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.68 
 
 		 594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  26.55 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 860 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.6 
 
 		 571 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 592 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  31.38 
 
 		 572 aa  115  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 543 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 883 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 		 3172 aa  113  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 572 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 		 592 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 613 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  25.85 
 
 		 864 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 613 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.9 
 
 		 1979 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  24.19 
 
 		 613 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 632 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 927 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  22.98 
 
 		 575 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.1 
 
 		 887 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 643 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 576 aa  106  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  42.19 
 
 		 642 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  23.63 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  24.51 
 
 		 606 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  25.91 
 
 		 591 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 606 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>