More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0566 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
610 aa  1231    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  65.3 
 
 
607 aa  823    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  64.24 
 
 
619 aa  775    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  95.63 
 
 
610 aa  1148    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  47.11 
 
 
621 aa  521  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  47.11 
 
 
621 aa  521  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  46.56 
 
 
621 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  43.73 
 
 
677 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
579 aa  381  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  38.74 
 
 
617 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  38.51 
 
 
593 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 
617 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  38.49 
 
 
622 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.7 
 
 
619 aa  363  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.67 
 
 
594 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  37.33 
 
 
592 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  38.33 
 
 
593 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  39.72 
 
 
583 aa  362  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
631 aa  360  4e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.21 
 
 
633 aa  360  4e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  37.64 
 
 
572 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.57 
 
 
633 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  36.55 
 
 
585 aa  352  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 
592 aa  352  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  34.64 
 
 
576 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  34.06 
 
 
595 aa  307  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
566 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  32.43 
 
 
572 aa  280  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 
566 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  42.5 
 
 
425 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
642 aa  258  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  34.02 
 
 
584 aa  253  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  32.27 
 
 
566 aa  247  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
599 aa  217  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
571 aa  213  7.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 
573 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
612 aa  172  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  36.15 
 
 
573 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.7 
 
 
566 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.86 
 
 
572 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.01 
 
 
572 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  31.64 
 
 
568 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
594 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
722 aa  134  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  36.36 
 
 
562 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  32.17 
 
 
573 aa  130  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
581 aa  120  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  27.48 
 
 
573 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2662  tetratricopeptide domain-containing protein  25.9 
 
 
557 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0513511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  40.91 
 
 
482 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  27.48 
 
 
586 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  30.26 
 
 
573 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  30.74 
 
 
632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  36 
 
 
616 aa  116  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.86 
 
 
557 aa  114  6e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.83 
 
 
603 aa  113  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.99 
 
 
553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  34.85 
 
 
606 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  34.85 
 
 
606 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
606 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  34.85 
 
 
606 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  34.85 
 
 
606 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
606 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  34.85 
 
 
606 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  28 
 
 
635 aa  111  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  31.94 
 
 
591 aa  110  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  34.02 
 
 
606 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.97 
 
 
571 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  35.32 
 
 
609 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 
594 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
607 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  32.5 
 
 
607 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 
607 aa  107  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
616 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
607 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 
574 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 
613 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  38.61 
 
 
494 aa  104  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 
607 aa  104  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 
565 aa  103  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
607 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
607 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
878 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  32.23 
 
 
613 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 
613 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  32.37 
 
 
620 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
572 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 
592 aa  99  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
767 aa  99  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 
548 aa  98.6  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 
638 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.48 
 
 
810 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.01 
 
 
632 aa  97.1  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  30.04 
 
 
587 aa  95.9  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.81 
 
 
582 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.04 
 
 
804 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
563 aa  92.8  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
606 aa  91.3  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>