More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1034 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 548 aa  1083    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.62 
 
 		 557 aa  205  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.84 
 
 		 553 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.58 
 
 		 603 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.91 
 
 		 573 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.24 
 
 		 599 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 562 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 568 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 573 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 581 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.17 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.23 
 
 		 573 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.59 
 
 		 572 aa  100  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 610 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1276 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.69 
 
 		 572 aa  98.6  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 		 563 aa  97.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  25.61 
 
 		 586 aa  96.3  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.54 
 
 		 610 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 565 aa  96.7  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 722 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 595 aa  91.3  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 677 aa  90.5  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 573 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.74 
 
 		 581 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 		 621 aa  87.8  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.15 
 
 		 582 aa  87.4  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 607 aa  87  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  21.88 
 
 		 572 aa  87  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 		 621 aa  86.7  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 576 aa  84.7  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 		 448 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  24.79 
 
 		 619 aa  84.3  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 573 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 		 784 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 575 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  26.69 
 
 		 573 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 621 aa  81.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 878 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 592 aa  81.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  22.24 
 
 		 584 aa  81.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  27.9 
 
 		 583 aa  80.9  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.88 
 
 		 810 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  27.12 
 
 		 593 aa  80.5  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 566 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  30.47 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  28.5 
 
 		 575 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  33.88 
 
 		 592 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  26.04 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.04 
 
 		 1979 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 934 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  33.88 
 
 		 593 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.06 
 
 		 594 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 617 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 464 aa  76.6  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 642 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  21.97 
 
 		 635 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 573 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  20.14 
 
 		 4079 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.04 
 
 		 571 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.69 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  33.06 
 
 		 592 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  21.43 
 
 		 584 aa  76.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 927 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 612 aa  74.7  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.84 
 
 		 929 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.52 
 
 		 745 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.05 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  26.97 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  27.71 
 
 		 587 aa  74.3  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1186  tetratricopeptide TPR_2  34.82 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0407507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.87 
 
 		 574 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  21.73 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  26.37 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.04 
 
 		 1737 aa  73.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.68 
 
 		 571 aa  73.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 622 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  22.59 
 
 		 579 aa  72.8  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.58 
 
 		 579 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  34.92 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3145 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.72 
 
 		 1013 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 617 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 750 aa  71.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  28.89 
 
 		 584 aa  70.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 602 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 638 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>