More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0588 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 571 aa  1165    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.14 
 
 		 582 aa  443  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 591 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.55 
 
 		 577 aa  361  2e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.69 
 
 		 579 aa  349  9e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  34.96 
 
 		 586 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1768  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.65 
 
 		 612 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.16 
 
 		 602 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0021  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 593 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.6 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  23.96 
 
 		 729 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.02 
 
 		 557 aa  114  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 568 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.29 
 
 		 573 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 573 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.01 
 
 		 572 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 729 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 		 572 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 767 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  21.56 
 
 		 579 aa  100  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 581 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1676 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 900 aa  97.1  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 594 aa  94  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  44.33 
 
 		 722 aa  91.3  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  35.81 
 
 		 632 aa  91.3  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.58 
 
 		 566 aa  90.5  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 617 aa  90.5  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 		 594 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  32.74 
 
 		 593 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 565 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.62 
 
 		 864 aa  87.4  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 229 aa  87.4  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  32.54 
 
 		 603 aa  86.7  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 804 aa  86.7  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.54 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  42.99 
 
 		 584 aa  86.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  26.25 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  36.75 
 
 		 677 aa  84.3  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  38.39 
 
 		 621 aa  84  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.53 
 
 		 1056 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  38.39 
 
 		 621 aa  84  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  39.23 
 
 		 552 aa  84  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 556 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 621 aa  83.2  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 		 860 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  35.29 
 
 		 583 aa  82.8  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  24.15 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  28.25 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.54 
 
 		 574 aa  82  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 566 aa  82  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.85 
 
 		 883 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  40 
 
 		 592 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  34.85 
 
 		 584 aa  81.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.74 
 
 		 2240 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.5 
 
 		 924 aa  81.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21 
 
 		 1056 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  39 
 
 		 592 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  31.89 
 
 		 586 aa  80.1  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  38.66 
 
 		 593 aa  80.1  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  24.84 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38 
 
 		 594 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  36.8 
 
 		 591 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 573 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  22.91 
 
 		 574 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 883 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 643 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 		 638 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 592 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  29.75 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  35.34 
 
 		 619 aa  78.2  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  23.65 
 
 		 590 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 934 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  23.19 
 
 		 575 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.72 
 
 		 564 aa  76.6  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 927 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.55 
 
 		 1694 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 576 aa  75.1  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.04 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 		 579 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.85 
 
 		 935 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2297  TPR domain-containing protein  37.17 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 572 aa  74.7  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.66 
 
 		 929 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1030  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.023544  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  23.49 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.3 
 
 		 1022 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.94 
 
 		 784 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 575 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>