More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0586 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  100 
 
 
573 aa  1164    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  43.8 
 
 
562 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  45.49 
 
 
592 aa  438  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  42.91 
 
 
572 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 
581 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.98 
 
 
571 aa  342  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  38.33 
 
 
607 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
607 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
607 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  37.96 
 
 
606 aa  335  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  37.66 
 
 
607 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  36.45 
 
 
635 aa  333  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  38.39 
 
 
607 aa  332  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 
607 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  37.59 
 
 
607 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  37.22 
 
 
606 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  37.22 
 
 
606 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  37.22 
 
 
606 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  37.22 
 
 
606 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  37.22 
 
 
606 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  37.22 
 
 
606 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  37.22 
 
 
606 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 
613 aa  323  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  35.56 
 
 
613 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
613 aa  320  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 
616 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.62 
 
 
645 aa  302  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.58 
 
 
574 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  36.27 
 
 
645 aa  300  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  35.01 
 
 
642 aa  293  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  31.4 
 
 
586 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  34.99 
 
 
584 aa  267  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  32.52 
 
 
575 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 
556 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  31.73 
 
 
590 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  32.63 
 
 
603 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 
585 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  32.99 
 
 
574 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 
553 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  31.62 
 
 
625 aa  250  5e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  33.75 
 
 
616 aa  250  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  31.19 
 
 
575 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  32.91 
 
 
594 aa  246  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  32.19 
 
 
587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  31.89 
 
 
584 aa  243  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  32.47 
 
 
573 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  31.96 
 
 
591 aa  243  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
573 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
599 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  32.3 
 
 
573 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
575 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  30.19 
 
 
620 aa  241  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
574 aa  240  4e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  32.5 
 
 
609 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  31.86 
 
 
573 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  30.63 
 
 
595 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.14 
 
 
582 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
595 aa  229  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  31.68 
 
 
520 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  30.29 
 
 
619 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.78 
 
 
564 aa  166  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
594 aa  162  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  38.55 
 
 
551 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  38.65 
 
 
559 aa  154  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  37.45 
 
 
559 aa  151  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 
606 aa  147  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 
574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  39.9 
 
 
464 aa  141  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  41.72 
 
 
494 aa  141  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  41.15 
 
 
495 aa  139  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
603 aa  137  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.57 
 
 
572 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
567 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 
573 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 
595 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 
572 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.17 
 
 
573 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 
594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.96 
 
 
573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  32.68 
 
 
619 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
610 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.18 
 
 
610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  30.31 
 
 
621 aa  115  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  30.31 
 
 
621 aa  114  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
621 aa  113  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
568 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
607 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
562 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.75 
 
 
563 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  35.58 
 
 
572 aa  110  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 
566 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 
557 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
579 aa  108  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  31.84 
 
 
566 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  36.41 
 
 
642 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 
566 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  32.43 
 
 
425 aa  104  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  31.46 
 
 
583 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  28.82 
 
 
677 aa  103  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 
599 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>