More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4603 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 722 aa  1468    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.68 
 
 		 573 aa  161  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.1 
 
 		 572 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 566 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  26.46 
 
 		 573 aa  158  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 573 aa  157  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 568 aa  153  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 572 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 621 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 567 aa  148  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  31.41 
 
 		 621 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  31.41 
 
 		 621 aa  141  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  29.77 
 
 		 593 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 607 aa  135  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  28.94 
 
 		 619 aa  135  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 592 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  29.8 
 
 		 593 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 638 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 622 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 610 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  29.47 
 
 		 583 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.27 
 
 		 619 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 		 617 aa  132  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 617 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 642 aa  131  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  30.24 
 
 		 592 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.07 
 
 		 810 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.29 
 
 		 610 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.83 
 
 		 633 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  38.92 
 
 		 572 aa  127  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 579 aa  127  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.11 
 
 		 594 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  35.78 
 
 		 425 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 572 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 884 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 576 aa  125  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 		 633 aa  125  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 631 aa  124  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 585 aa  124  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  23.82 
 
 		 632 aa  124  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 620 aa  123  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 878 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  33.05 
 
 		 677 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 860 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1676 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  38.41 
 
 		 599 aa  114  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  34.42 
 
 		 566 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.95 
 
 		 804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.39 
 
 		 557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23.04 
 
 		 864 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 565 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  33.93 
 
 		 584 aa  110  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 		 563 aa  110  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 581 aa  107  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 595 aa  106  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  40.31 
 
 		 573 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.49 
 
 		 883 aa  104  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  32.44 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 729 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.55 
 
 		 574 aa  102  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  32.65 
 
 		 616 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.49 
 
 		 882 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 		 1737 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  35.94 
 
 		 571 aa  97.4  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  27.68 
 
 		 575 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 594 aa  96.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 556 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  27.01 
 
 		 520 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.59 
 
 		 548 aa  95.9  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.51 
 
 		 882 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 573 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 553 aa  95.5  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 632 aa  95.1  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.24 
 
 		 603 aa  95.1  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  41.41 
 
 		 574 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 566 aa  94.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  37.89 
 
 		 562 aa  94.7  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  40.31 
 
 		 575 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  32.47 
 
 		 586 aa  93.6  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 612 aa  93.2  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.64 
 
 		 582 aa  92  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 643 aa  92  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  33.83 
 
 		 587 aa  92.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  23.25 
 
 		 733 aa  92.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 		 2240 aa  92  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 564 aa  91.7  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.33 
 
 		 571 aa  91.3  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.28 
 
 		 732 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.16 
 
 		 632 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  32.74 
 
 		 573 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 639 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 552 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 573 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 599 aa  88.6  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  22.4 
 
 		 729 aa  88.6  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 573 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 581 aa  88.2  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>