More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1499 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 620 aa  1257    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 878 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.16 
 
 		 810 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 722 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  25.22 
 
 		 864 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 883 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 1737 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 927 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 567 aa  98.6  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.53 
 
 		 887 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 884 aa  96.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1276 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.19 
 
 		 882 aa  94.4  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 934 aa  93.2  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.23 
 
 		 882 aa  92  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.09 
 
 		 816 aa  90.9  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.89 
 
 		 884 aa  90.1  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 505 aa  89.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 685 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 4079 aa  88.2  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.27 
 
 		 543 aa  87.8  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  25.42 
 
 		 594 aa  87.4  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 900 aa  87.4  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 767 aa  87.4  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.84 
 
 		 1694 aa  87  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 612 aa  85.1  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.47 
 
 		 725 aa  84.7  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.5 
 
 		 2240 aa  84  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  21.84 
 
 		 929 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.6 
 
 		 563 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  21.5 
 
 		 568 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1676 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1069 aa  79.7  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 860 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.93 
 
 		 632 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 613 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 729 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.9 
 
 		 599 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  24.28 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.55 
 
 		 3301 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.34 
 
 		 935 aa  78.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 615 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.24 
 
 		 574 aa  77.8  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 637 aa  77  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.12 
 
 		 3172 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 613 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 681 aa  76.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 909 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.08 
 
 		 784 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.6 
 
 		 626 aa  77  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.14 
 
 		 988 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.37 
 
 		 1486 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  26.12 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2447  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 318 aa  76.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 677 aa  76.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  20.29 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 931 aa  74.3  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 955 aa  74.3  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 952 aa  73.9  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  38.03 
 
 		 642 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.71 
 
 		 795 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  30.3 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 572 aa  73.6  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 		 1297 aa  73.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 566 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.24 
 
 		 764 aa  73.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 		 593 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.77 
 
 		 574 aa  72.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  23.29 
 
 		 924 aa  72.4  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.18 
 
 		 729 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 634 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  37.78 
 
 		 562 aa  72  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 607 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.94 
 
 		 622 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.51 
 
 		 689 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.48 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 607 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.11 
 
 		 579 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  25.12 
 
 		 607 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.29 
 
 		 603 aa  70.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  24.4 
 
 		 780 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.29 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 617 aa  70.9  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  25.27 
 
 		 587 aa  70.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  34.51 
 
 		 734 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 559 aa  70.5  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.92 
 
 		 573 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 621 aa  70.1  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 362 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 638 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  37.25 
 
 		 559 aa  70.1  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  23.69 
 
 		 661 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  27.07 
 
 		 572 aa  70.1  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>