More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0342 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 582 aa  1132    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.5 
 
 		 574 aa  349  7e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  36.43 
 
 		 584 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 556 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  34.45 
 
 		 575 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  38.04 
 
 		 520 aa  262  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 575 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  33.51 
 
 		 574 aa  247  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.19 
 
 		 564 aa  241  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 		 586 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  30.14 
 
 		 573 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  35.1 
 
 		 573 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  34.62 
 
 		 590 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  36.85 
 
 		 551 aa  230  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  34.48 
 
 		 575 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  30.92 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 573 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  33.74 
 
 		 573 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 573 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  31.33 
 
 		 591 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 572 aa  211  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 592 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 585 aa  209  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  34.09 
 
 		 559 aa  198  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 607 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.22 
 
 		 571 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 613 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 607 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  28.65 
 
 		 613 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  29.16 
 
 		 607 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 		 613 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  29.16 
 
 		 607 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 607 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  29.87 
 
 		 606 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 606 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  30.09 
 
 		 606 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 606 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 616 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  30.09 
 
 		 606 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  30.09 
 
 		 606 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  30.09 
 
 		 606 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  30.09 
 
 		 606 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 607 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  28.7 
 
 		 642 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.15 
 
 		 553 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  29.15 
 
 		 603 aa  167  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.74 
 
 		 645 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  27.55 
 
 		 645 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  29.39 
 
 		 635 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  29.95 
 
 		 619 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  29.45 
 
 		 620 aa  146  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  29.29 
 
 		 616 aa  137  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 584 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 595 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  29.94 
 
 		 625 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  44.95 
 
 		 464 aa  128  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  28.35 
 
 		 609 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 594 aa  123  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 603 aa  123  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 574 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 		 606 aa  121  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  41.34 
 
 		 572 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  40.24 
 
 		 587 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  30.28 
 
 		 594 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 594 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  27.19 
 
 		 595 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 607 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  36.57 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 566 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 595 aa  98.6  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  39.86 
 
 		 566 aa  98.6  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 677 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 566 aa  97.8  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  32.43 
 
 		 619 aa  97.8  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 592 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  34.67 
 
 		 494 aa  96.3  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 579 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.47 
 
 		 557 aa  95.9  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  30.56 
 
 		 583 aa  94.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  30.56 
 
 		 592 aa  94  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 594 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 593 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 610 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.81 
 
 		 610 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 		 722 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 642 aa  91.3  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  29.04 
 
 		 621 aa  90.5  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  29.04 
 
 		 621 aa  89.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  30.98 
 
 		 584 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.16 
 
 		 804 aa  89  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  35.97 
 
 		 593 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 		 599 aa  88.2  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  35.22 
 
 		 495 aa  87.8  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 767 aa  87.8  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 621 aa  87.4  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>