176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0954 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 595 aa  1177    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  57.21 
 
 		 599 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  60.04 
 
 		 574 aa  595  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  57.71 
 
 		 584 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  51.97 
 
 		 616 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  55.62 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  52.17 
 
 		 587 aa  545  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  50.49 
 
 		 625 aa  539  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  50.09 
 
 		 595 aa  525  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  44.39 
 
 		 620 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  47.35 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 		 613 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  35.47 
 
 		 613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 613 aa  269  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 		 607 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 607 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  34.12 
 
 		 607 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 607 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 607 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  34.05 
 
 		 607 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  34.55 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  34.55 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  35.12 
 
 		 635 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  34.55 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  34.55 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  34.55 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  34.36 
 
 		 606 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 616 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 607 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.09 
 
 		 571 aa  233  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  31.29 
 
 		 573 aa  229  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  31.93 
 
 		 562 aa  228  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  32.92 
 
 		 645 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.92 
 
 		 645 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  31.89 
 
 		 642 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 592 aa  218  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 572 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 581 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 556 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  34.98 
 
 		 590 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  32.72 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 573 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  35 
 
 		 573 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 573 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  31.58 
 
 		 574 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  34.67 
 
 		 575 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.46 
 
 		 574 aa  156  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  34.21 
 
 		 520 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  29.24 
 
 		 586 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  30.44 
 
 		 584 aa  150  5e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  47.33 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  48.61 
 
 		 495 aa  141  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 585 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  35.09 
 
 		 591 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.83 
 
 		 553 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.83 
 
 		 603 aa  134  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 594 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.37 
 
 		 574 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.82 
 
 		 582 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 603 aa  124  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  36.99 
 
 		 619 aa  123  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  34.52 
 
 		 551 aa  117  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.16 
 
 		 564 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 559 aa  104  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  33.73 
 
 		 559 aa  104  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 464 aa  101  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 606 aa  92  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 567 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 		 599 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 562 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 566 aa  87.4  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  30.12 
 
 		 425 aa  87  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 579 aa  84.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  31.19 
 
 		 621 aa  84  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  30.05 
 
 		 619 aa  83.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.96 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  31.19 
 
 		 621 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 594 aa  83.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  33.82 
 
 		 593 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  34.56 
 
 		 583 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  26.55 
 
 		 677 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 592 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  33.57 
 
 		 592 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 585 aa  80.9  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  34.25 
 
 		 632 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 617 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 722 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 617 aa  79  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 		 594 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 572 aa  77.8  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  32.35 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.98 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.09 
 
 		 619 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.77 
 
 		 582 aa  76.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>