More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1506 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  77.92 
 
 
607 aa  944    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  79.24 
 
 
607 aa  965    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  100 
 
 
606 aa  1191    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  100 
 
 
606 aa  1191    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  100 
 
 
606 aa  1191    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
606 aa  1191    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  69.41 
 
 
613 aa  813    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  100 
 
 
606 aa  1191    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  79.41 
 
 
607 aa  949    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  78.91 
 
 
607 aa  933    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  77.92 
 
 
607 aa  944    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  96.53 
 
 
606 aa  1129    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  70.47 
 
 
613 aa  800    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  100 
 
 
606 aa  1191    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  69.74 
 
 
613 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
606 aa  1191    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  79.24 
 
 
607 aa  965    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  79.41 
 
 
607 aa  966    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  43.48 
 
 
635 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  45.42 
 
 
616 aa  435  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  41.85 
 
 
645 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  43.09 
 
 
642 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.91 
 
 
645 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  38.88 
 
 
562 aa  350  4e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  37.22 
 
 
573 aa  325  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
592 aa  291  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  36.56 
 
 
587 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  35.27 
 
 
584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  36.85 
 
 
599 aa  282  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
574 aa  281  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  36.98 
 
 
594 aa  279  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  35.86 
 
 
616 aa  278  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  33.83 
 
 
625 aa  278  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.51 
 
 
571 aa  276  6e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  36.27 
 
 
620 aa  273  9e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  36.14 
 
 
609 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
595 aa  266  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  33.21 
 
 
572 aa  264  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 
581 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  30.64 
 
 
595 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 
556 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  30.13 
 
 
575 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  30.13 
 
 
590 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  31.63 
 
 
574 aa  210  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  31.16 
 
 
520 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  30.71 
 
 
575 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 
575 aa  208  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  31.42 
 
 
584 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 
553 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  31.68 
 
 
603 aa  204  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  30.77 
 
 
573 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 
573 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 
573 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 
573 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  29.66 
 
 
586 aa  191  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.59 
 
 
574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
585 aa  170  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  50 
 
 
494 aa  167  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 
591 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.09 
 
 
582 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  50 
 
 
495 aa  161  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.01 
 
 
574 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
603 aa  142  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.26 
 
 
564 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  31.22 
 
 
551 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
594 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.59 
 
 
581 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  43.31 
 
 
559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  43.31 
 
 
559 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  32.97 
 
 
677 aa  126  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
606 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 
464 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  34.38 
 
 
583 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 
595 aa  121  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  33.48 
 
 
593 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  29.23 
 
 
619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  33.75 
 
 
566 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
617 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  31.27 
 
 
619 aa  114  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 
619 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.98 
 
 
572 aa  114  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 
617 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  30.39 
 
 
425 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  31.84 
 
 
593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  32.74 
 
 
592 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
566 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 
572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.84 
 
 
594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
592 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
610 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.49 
 
 
573 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
607 aa  110  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.85 
 
 
610 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 
622 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
585 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 
572 aa  108  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 
579 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  30.83 
 
 
572 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  30.99 
 
 
584 aa  107  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>