165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3601 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 603 aa  1226    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 585 aa  150  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.94 
 
 		 574 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  26.31 
 
 		 574 aa  144  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 606 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  27.17 
 
 		 606 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 606 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 606 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 606 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 606 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  27.17 
 
 		 606 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 607 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 607 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 607 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 607 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  27.24 
 
 		 607 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 607 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 607 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  27.04 
 
 		 573 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  26.41 
 
 		 606 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 575 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  24.91 
 
 		 575 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 556 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 581 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  27.66 
 
 		 613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  38.01 
 
 		 592 aa  127  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 573 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  40.12 
 
 		 562 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  39.53 
 
 		 591 aa  124  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 595 aa  124  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 613 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  25.87 
 
 		 586 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.83 
 
 		 582 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  26.33 
 
 		 520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  26.74 
 
 		 587 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 572 aa  120  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  38.27 
 
 		 573 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  35.68 
 
 		 584 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  37.65 
 
 		 573 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  38.89 
 
 		 590 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  38.89 
 
 		 575 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.51 
 
 		 574 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 573 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  38.65 
 
 		 494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  26.52 
 
 		 616 aa  113  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.67 
 
 		 571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  38.22 
 
 		 613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.09 
 
 		 603 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.09 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  25.97 
 
 		 645 aa  109  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  38.56 
 
 		 595 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  36.41 
 
 		 625 aa  108  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  25.77 
 
 		 642 aa  107  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  24.04 
 
 		 619 aa  105  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  36.36 
 
 		 594 aa  104  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 584 aa  103  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 559 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  33.15 
 
 		 635 aa  102  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 574 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  36.65 
 
 		 620 aa  101  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 599 aa  101  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  34.48 
 
 		 495 aa  101  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.92 
 
 		 557 aa  100  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  24.2 
 
 		 551 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 		 616 aa  98.6  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  23.74 
 
 		 559 aa  98.2  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.89 
 
 		 645 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 464 aa  95.9  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.95 
 
 		 564 aa  94.4  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  36.81 
 
 		 609 aa  93.2  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 595 aa  91.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 568 aa  90.9  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  24.33 
 
 		 593 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 621 aa  84  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.06 
 
 		 594 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 579 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  28.26 
 
 		 677 aa  82  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 617 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 592 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.97 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 607 aa  80.9  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  26.96 
 
 		 583 aa  80.9  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.68 
 
 		 610 aa  80.5  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  28.7 
 
 		 592 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  32.56 
 
 		 572 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 594 aa  80.1  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 576 aa  79.7  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 573 aa  80.1  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  31.54 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 610 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  31.54 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 599 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.12 
 
 		 632 aa  75.5  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  31.34 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  30.6 
 
 		 566 aa  73.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 593 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 566 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  20.54 
 
 		 573 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>