More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0391 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 606 aa  1234    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  24.12 
 
 		 586 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 592 aa  157  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  22.91 
 
 		 573 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  25.6 
 
 		 575 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  25.77 
 
 		 590 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  25.59 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.4 
 
 		 553 aa  145  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  25.37 
 
 		 562 aa  141  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 572 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  23.89 
 
 		 584 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 585 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 		 575 aa  135  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  24.27 
 
 		 574 aa  134  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  24.64 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  25.04 
 
 		 575 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 		 571 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  24.32 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  24.32 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  24.32 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  24.32 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  24.32 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  23.77 
 
 		 607 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 607 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  23.43 
 
 		 573 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  25.37 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 607 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 607 aa  122  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 573 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 		 574 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 613 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 607 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 573 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  23.74 
 
 		 613 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.1 
 
 		 582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 573 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  23.9 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  23.99 
 
 		 591 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 616 aa  107  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 594 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  29.91 
 
 		 619 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  33.07 
 
 		 632 aa  97.4  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 		 574 aa  94.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  27.02 
 
 		 616 aa  94.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  25.31 
 
 		 594 aa  94  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 572 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  30.3 
 
 		 677 aa  93.2  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.6 
 
 		 610 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 595 aa  92  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  25.81 
 
 		 609 aa  90.9  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 610 aa  90.5  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  22.14 
 
 		 645 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 		 557 aa  89  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  27.13 
 
 		 621 aa  88.6  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 584 aa  88.6  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 568 aa  88.2  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 579 aa  88.2  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  27.89 
 
 		 621 aa  87.8  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  30.64 
 
 		 592 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 464 aa  87.4  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  32.14 
 
 		 583 aa  87  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  29.35 
 
 		 593 aa  87  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  32.57 
 
 		 595 aa  86.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 592 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  29.88 
 
 		 566 aa  86.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 567 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.64 
 
 		 594 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  26.23 
 
 		 587 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.4 
 
 		 645 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 617 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 621 aa  84.7  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 576 aa  84.7  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.18 
 
 		 599 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  33.33 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  30.06 
 
 		 593 aa  84.3  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  30.2 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  31.51 
 
 		 584 aa  83.6  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  23.3 
 
 		 619 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 585 aa  82.8  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  35.94 
 
 		 642 aa  82  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  29.63 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 		 617 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  32.86 
 
 		 620 aa  82  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  30.57 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 		 564 aa  81.3  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 607 aa  80.5  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 562 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.49 
 
 		 573 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.97 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 573 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  29.8 
 
 		 595 aa  78.2  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  26.94 
 
 		 573 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>