More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2475 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 632 aa  1297    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 573 aa  220  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.58 
 
 		 567 aa  209  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  29.43 
 
 		 573 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  29.25 
 
 		 573 aa  183  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 572 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 594 aa  177  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.47 
 
 		 572 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 594 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.75 
 
 		 566 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.68 
 
 		 563 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1676 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 621 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  33.05 
 
 		 593 aa  134  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 722 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  34.5 
 
 		 572 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  33.91 
 
 		 677 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  32.35 
 
 		 583 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 		 621 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 883 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 		 621 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  31.33 
 
 		 593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 		 566 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 579 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 562 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  42.96 
 
 		 638 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 594 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 599 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  30.9 
 
 		 592 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 572 aa  123  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.03 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 878 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 610 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 607 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 610 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 595 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  28.9 
 
 		 619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 566 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.49 
 
 		 810 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  28.79 
 
 		 425 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.3 
 
 		 574 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  30.74 
 
 		 566 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 599 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  29.68 
 
 		 591 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23.43 
 
 		 864 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  27.96 
 
 		 562 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 		 884 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  28.78 
 
 		 613 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 617 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 		 613 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 		 566 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 556 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  31.56 
 
 		 575 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 576 aa  110  8.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 592 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  31.92 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  25.08 
 
 		 603 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.08 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  37.33 
 
 		 584 aa  109  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  29.54 
 
 		 616 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 622 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 585 aa  109  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 612 aa  108  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 767 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 572 aa  108  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  23.66 
 
 		 586 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.51 
 
 		 633 aa  106  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.79 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  29.63 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 552 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 505 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.93 
 
 		 633 aa  105  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 3145 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 		 607 aa  104  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 631 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 860 aa  104  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 573 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 573 aa  103  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 607 aa  103  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  23.93 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.47 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 607 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  31.14 
 
 		 607 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  31.14 
 
 		 607 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.97 
 
 		 581 aa  102  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 573 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 606 aa  100  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  28.36 
 
 		 606 aa  100  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.33 
 
 		 882 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.38 
 
 		 729 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 599 aa  98.6  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.86 
 
 		 2240 aa  98.6  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>