More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1154 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 511 aa  1026    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 573 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.82 
 
 		 603 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.94 
 
 		 566 aa  123  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  25.21 
 
 		 575 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 573 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  27.08 
 
 		 562 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 616 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  24.73 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 556 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.41 
 
 		 573 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  26.51 
 
 		 573 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 		 567 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.52 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  25.89 
 
 		 590 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  25.34 
 
 		 575 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 		 572 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  24.78 
 
 		 635 aa  101  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  29.96 
 
 		 632 aa  100  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.72 
 
 		 572 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  27.06 
 
 		 586 aa  98.2  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 573 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  24.51 
 
 		 613 aa  97.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 607 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 607 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  24.63 
 
 		 607 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  26.18 
 
 		 520 aa  95.1  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  24.93 
 
 		 606 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  24.93 
 
 		 606 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  24.93 
 
 		 606 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  24.93 
 
 		 606 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  24.93 
 
 		 606 aa  94.4  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 606 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 606 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1069 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  24.05 
 
 		 606 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 607 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 607 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 613 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  24.53 
 
 		 584 aa  90.5  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 613 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 607 aa  90.1  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.82 
 
 		 574 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  24.4 
 
 		 573 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 792 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 767 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 585 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 610 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 607 aa  87.8  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  27.27 
 
 		 619 aa  87.8  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 581 aa  87.4  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 572 aa  87  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 927 aa  86.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 607 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 620 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  29.27 
 
 		 583 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.31 
 
 		 1694 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  26.88 
 
 		 594 aa  84.7  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 		 677 aa  84  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 579 aa  84  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 		 1979 aa  84  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 955 aa  84  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 594 aa  82.8  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.69 
 
 		 810 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.29 
 
 		 574 aa  82.8  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.92 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 860 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  37.1 
 
 		 609 aa  82  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 552 aa  82  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 784 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1276 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.44 
 
 		 571 aa  80.9  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 642 aa  80.9  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 878 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 4079 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 		 610 aa  80.9  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 572 aa  80.5  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 617 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  29.67 
 
 		 592 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 576 aa  78.2  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.79 
 
 		 594 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 592 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  25.47 
 
 		 587 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  33.05 
 
 		 573 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 617 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  28.64 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 603 aa  77.8  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 595 aa  77.4  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  32.87 
 
 		 621 aa  77  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  32.87 
 
 		 621 aa  77  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 565 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 450 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1421 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>