More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0511 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 581 aa  1167    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  35.24 
 
 		 573 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.3 
 
 		 574 aa  316  9e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  35.56 
 
 		 562 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  39.43 
 
 		 592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 		 585 aa  306  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.77 
 
 		 571 aa  292  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  36.14 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  33.63 
 
 		 575 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 556 aa  276  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  35.82 
 
 		 590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 613 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  33.57 
 
 		 591 aa  270  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  32.75 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  34.85 
 
 		 575 aa  266  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  35.45 
 
 		 520 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 607 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 607 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 607 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  34.54 
 
 		 575 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  33.09 
 
 		 607 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 582 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  34.39 
 
 		 573 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 573 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 573 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 607 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 607 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  34.22 
 
 		 573 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  30.43 
 
 		 635 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 607 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  33.21 
 
 		 613 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 613 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  32.38 
 
 		 606 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  32.67 
 
 		 606 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 606 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 606 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  32.67 
 
 		 606 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  32.67 
 
 		 606 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  32.67 
 
 		 606 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  32.67 
 
 		 606 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  33.04 
 
 		 584 aa  251  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 616 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  31.42 
 
 		 572 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  30.2 
 
 		 645 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  31.31 
 
 		 642 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.49 
 
 		 645 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.03 
 
 		 564 aa  236  7e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  32.04 
 
 		 616 aa  227  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  31.38 
 
 		 587 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  31.19 
 
 		 603 aa  217  5e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  32.75 
 
 		 609 aa  216  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.19 
 
 		 553 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  33.71 
 
 		 551 aa  212  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 		 599 aa  211  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  31.34 
 
 		 625 aa  210  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 		 574 aa  210  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 584 aa  203  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  31.14 
 
 		 594 aa  193  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  29.09 
 
 		 620 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 595 aa  187  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  27.36 
 
 		 595 aa  186  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 559 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  31.59 
 
 		 559 aa  184  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  41.24 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 594 aa  147  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  29.9 
 
 		 619 aa  147  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 595 aa  147  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 567 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  38.31 
 
 		 494 aa  140  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 603 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 562 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  42.57 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.74 
 
 		 573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.84 
 
 		 572 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 568 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 		 599 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 		 572 aa  123  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  28.81 
 
 		 619 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  35.29 
 
 		 572 aa  123  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.39 
 
 		 573 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 573 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 610 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.3 
 
 		 566 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.36 
 
 		 610 aa  120  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.13 
 
 		 563 aa  117  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  33.61 
 
 		 425 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 621 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 		 572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.9 
 
 		 619 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.64 
 
 		 632 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.75 
 
 		 582 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 		 576 aa  109  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  30.4 
 
 		 621 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 		 633 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  30.4 
 
 		 621 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 617 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.37 
 
 		 633 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>