More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0318 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  68.74 
 
 		 606 aa  801    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  68.74 
 
 		 606 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  68.9 
 
 		 607 aa  808    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  68.41 
 
 		 607 aa  823    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 613 aa  1225    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  68.74 
 
 		 606 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  68.25 
 
 		 607 aa  817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  68.41 
 
 		 607 aa  823    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  68.74 
 
 		 606 aa  801    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  68.74 
 
 		 606 aa  801    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  68.58 
 
 		 606 aa  810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  68.25 
 
 		 607 aa  817    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  68.74 
 
 		 606 aa  801    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  68.25 
 
 		 607 aa  821    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  83.36 
 
 		 613 aa  988    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  68.74 
 
 		 606 aa  801    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  68.25 
 
 		 607 aa  821    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  83.69 
 
 		 613 aa  1009    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  44.41 
 
 		 635 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  44.32 
 
 		 616 aa  438  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  42.19 
 
 		 645 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  44.42 
 
 		 642 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.5 
 
 		 645 aa  428  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  38.67 
 
 		 562 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  35.56 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  37.04 
 
 		 587 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 584 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 		 599 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  36.87 
 
 		 574 aa  300  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  36.08 
 
 		 616 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  35 
 
 		 620 aa  293  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  33.33 
 
 		 625 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  36.55 
 
 		 594 aa  285  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  35.22 
 
 		 572 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 592 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  36.25 
 
 		 609 aa  283  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 595 aa  279  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  31.99 
 
 		 595 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.07 
 
 		 571 aa  264  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  32.18 
 
 		 590 aa  232  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  32.18 
 
 		 575 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 575 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  32.17 
 
 		 575 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  31.99 
 
 		 556 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  32.42 
 
 		 574 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  29.51 
 
 		 586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  31.16 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 573 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  32.41 
 
 		 573 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 573 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 573 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  31.17 
 
 		 603 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  30.05 
 
 		 584 aa  206  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.17 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 		 574 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 582 aa  178  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  27.73 
 
 		 591 aa  174  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  49.37 
 
 		 494 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  51.35 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.83 
 
 		 564 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  30.43 
 
 		 551 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 		 574 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 594 aa  138  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  31.36 
 
 		 559 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  41.4 
 
 		 559 aa  127  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 464 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 595 aa  124  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 603 aa  124  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 562 aa  124  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 606 aa  123  9e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  32.01 
 
 		 619 aa  123  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 		 581 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 573 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  32.29 
 
 		 593 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 617 aa  116  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 567 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  30.59 
 
 		 583 aa  115  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.33 
 
 		 599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  29.89 
 
 		 425 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  26.72 
 
 		 573 aa  110  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  26.06 
 
 		 573 aa  110  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.84 
 
 		 594 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27.89 
 
 		 632 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  30.3 
 
 		 592 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 617 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 572 aa  106  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 592 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  28.57 
 
 		 584 aa  104  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 585 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  29.2 
 
 		 593 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  28.73 
 
 		 677 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 579 aa  103  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  27.8 
 
 		 619 aa  103  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 607 aa  103  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 566 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 610 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>