More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5316 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  66.9 
 
 		 573 aa  744    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  68.82 
 
 		 575 aa  822    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  70.56 
 
 		 575 aa  814    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  70.4 
 
 		 556 aa  810    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  67.07 
 
 		 573 aa  738    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  67.07 
 
 		 573 aa  748    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  97.74 
 
 		 590 aa  1095    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  70.52 
 
 		 520 aa  751    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  68.99 
 
 		 574 aa  830    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  67.42 
 
 		 573 aa  751    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1157    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  38.63 
 
 		 585 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  37.87 
 
 		 591 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 581 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 		 592 aa  278  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.1 
 
 		 574 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  33.27 
 
 		 586 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  35.28 
 
 		 584 aa  258  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  31.38 
 
 		 573 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  29.93 
 
 		 562 aa  242  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  31.18 
 
 		 635 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 607 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.1 
 
 		 582 aa  233  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 613 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 613 aa  233  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 607 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 607 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  33.9 
 
 		 607 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  31.67 
 
 		 613 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 607 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 607 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 607 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.09 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 		 606 aa  216  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  33.83 
 
 		 619 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 616 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  30.36 
 
 		 606 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  213  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  30.36 
 
 		 606 aa  213  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 572 aa  210  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  31.51 
 
 		 645 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.88 
 
 		 645 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  31.33 
 
 		 642 aa  204  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.79 
 
 		 553 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  30.25 
 
 		 603 aa  194  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 		 584 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  37.76 
 
 		 609 aa  180  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  27.57 
 
 		 595 aa  178  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  28.41 
 
 		 625 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  28.8 
 
 		 587 aa  177  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 574 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  32.18 
 
 		 551 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  34.12 
 
 		 594 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  35.44 
 
 		 616 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 595 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 564 aa  167  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  29.93 
 
 		 620 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 594 aa  163  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 606 aa  152  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  38.13 
 
 		 559 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  38.13 
 
 		 559 aa  150  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 		 574 aa  150  7e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  45.06 
 
 		 494 aa  136  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  43.83 
 
 		 495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  40.1 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 603 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 567 aa  110  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 573 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.68 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 595 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 562 aa  104  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 572 aa  100  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.69 
 
 		 599 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  28.99 
 
 		 677 aa  99.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  26.14 
 
 		 572 aa  98.2  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 594 aa  95.5  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 557 aa  95.9  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.15 
 
 		 573 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 579 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  24.83 
 
 		 573 aa  94  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 563 aa  92.8  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 585 aa  92.8  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 642 aa  92  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  25.3 
 
 		 632 aa  91.3  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 566 aa  90.5  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  28.81 
 
 		 425 aa  90.1  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 566 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  37.96 
 
 		 573 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 568 aa  87  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  28.35 
 
 		 619 aa  86.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2102  tetratricopeptide TPR_4  24.24 
 
 		 728 aa  85.5  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.892588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  27.7 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>