More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2382 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  100 
 
 		 603 aa  1099    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 553 aa  1097    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  32.63 
 
 		 573 aa  251  2e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  31.28 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 581 aa  216  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  32.28 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 607 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 607 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 607 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  31.6 
 
 		 607 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 613 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  33.46 
 
 		 592 aa  210  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 607 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 607 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 607 aa  206  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 613 aa  206  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  31.11 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  30.39 
 
 		 635 aa  204  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 606 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 616 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  31.11 
 
 		 606 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  31.21 
 
 		 584 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  31.87 
 
 		 642 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 572 aa  196  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  31.63 
 
 		 645 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.35 
 
 		 645 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  29.79 
 
 		 575 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  29.94 
 
 		 575 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  29.49 
 
 		 590 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.76 
 
 		 571 aa  186  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  29.79 
 
 		 586 aa  186  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  28.84 
 
 		 591 aa  183  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  30.78 
 
 		 520 aa  180  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 573 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.32 
 
 		 557 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  28.29 
 
 		 573 aa  174  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 573 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  29.93 
 
 		 609 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 585 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 573 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 573 aa  170  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 575 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 		 574 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  28.78 
 
 		 595 aa  163  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 		 594 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  34.11 
 
 		 594 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.15 
 
 		 582 aa  157  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  27.32 
 
 		 574 aa  156  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  28.2 
 
 		 599 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 574 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  28.25 
 
 		 587 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  27.81 
 
 		 620 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  28.75 
 
 		 625 aa  151  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.34 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 606 aa  145  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  30.28 
 
 		 551 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 		 567 aa  144  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.22 
 
 		 599 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.18 
 
 		 564 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 568 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.69 
 
 		 573 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 		 574 aa  137  4e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 595 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.79 
 
 		 573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 		 566 aa  133  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.58 
 
 		 548 aa  131  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  26.29 
 
 		 616 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  33.5 
 
 		 677 aa  127  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 511 aa  125  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 572 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 572 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 576 aa  120  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 464 aa  118  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  38.46 
 
 		 494 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 595 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 610 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  31.84 
 
 		 559 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 		 563 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  29.77 
 
 		 572 aa  113  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 559 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 594 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.97 
 
 		 610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.81 
 
 		 2240 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 579 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 565 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1676 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 607 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 572 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 603 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  24.95 
 
 		 593 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  38.1 
 
 		 495 aa  109  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  27.09 
 
 		 583 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>