More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1165 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 574 aa  1158    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  30.2 
 
 		 584 aa  208  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.35 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 585 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  27.37 
 
 		 581 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.82 
 
 		 582 aa  180  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  32.46 
 
 		 556 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 572 aa  169  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 607 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 607 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  30.13 
 
 		 607 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  31.89 
 
 		 575 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 		 607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  30.46 
 
 		 574 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  28.54 
 
 		 562 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 573 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 607 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  29.3 
 
 		 590 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.76 
 
 		 564 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  29.38 
 
 		 586 aa  159  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  29.08 
 
 		 606 aa  156  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 607 aa  156  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  30 
 
 		 575 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  30.09 
 
 		 573 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 573 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 573 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 575 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 613 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  28.01 
 
 		 606 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 606 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  28.01 
 
 		 606 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  28.01 
 
 		 606 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  28.01 
 
 		 606 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 606 aa  146  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  28.01 
 
 		 606 aa  146  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.81 
 
 		 603 aa  144  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  24.64 
 
 		 573 aa  144  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 		 553 aa  144  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  30.42 
 
 		 520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  37.45 
 
 		 616 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  28.18 
 
 		 591 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  27.9 
 
 		 613 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  27.98 
 
 		 625 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  27.69 
 
 		 587 aa  134  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  27.98 
 
 		 619 aa  134  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 595 aa  134  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  27.27 
 
 		 551 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  38.74 
 
 		 609 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.44 
 
 		 571 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 584 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 559 aa  130  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  27.12 
 
 		 635 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  27.34 
 
 		 559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  43.02 
 
 		 594 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  40.44 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  39.57 
 
 		 599 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  39.57 
 
 		 574 aa  127  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 616 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  42.21 
 
 		 494 aa  124  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  40.94 
 
 		 495 aa  123  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  39.51 
 
 		 620 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  23.69 
 
 		 642 aa  114  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 804 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  32.39 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  23.02 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  33.85 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0391  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 606 aa  104  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000447314  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  28.81 
 
 		 621 aa  104  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  28.81 
 
 		 621 aa  104  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 		 599 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  30.69 
 
 		 632 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.48 
 
 		 645 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 722 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  30.8 
 
 		 593 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 		 557 aa  100  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 579 aa  99.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  26.78 
 
 		 592 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 562 aa  97.4  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.61 
 
 		 594 aa  97.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 621 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  41.96 
 
 		 572 aa  95.1  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 592 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.41 
 
 		 573 aa  92.8  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 595 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.55 
 
 		 573 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 565 aa  92  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 617 aa  91.3  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 505 aa  90.9  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 566 aa  90.9  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 619 aa  90.5  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 573 aa  90.1  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  28.92 
 
 		 583 aa  90.1  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  40.52 
 
 		 593 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  35.56 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>