246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1623 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  77.98 
 
 		 494 aa  778    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1623  outer membrane lipoprotein LolB  100 
 
 		 495 aa  1006    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.84859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  50.63 
 
 		 606 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  51.35 
 
 		 607 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  50 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  50 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  47.4 
 
 		 607 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  50 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  50 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  50 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  47.98 
 
 		 607 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 606 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  47.98 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  47.98 
 
 		 607 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  47.98 
 
 		 607 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  47.98 
 
 		 607 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  43.28 
 
 		 599 aa  160  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  45.21 
 
 		 574 aa  160  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  51.35 
 
 		 613 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  46.67 
 
 		 620 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  49.32 
 
 		 613 aa  156  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  49.32 
 
 		 613 aa  156  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  45.45 
 
 		 609 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  44.72 
 
 		 584 aa  154  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  44.1 
 
 		 625 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.32 
 
 		 571 aa  150  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  45.88 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  40.8 
 
 		 562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1296  tetratricopeptide TPR_4  43.89 
 
 		 594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.251517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  41.45 
 
 		 616 aa  148  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  43.55 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  50.34 
 
 		 573 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  50.34 
 
 		 573 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  36.17 
 
 		 584 aa  142  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  48.61 
 
 		 595 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  41.15 
 
 		 573 aa  140  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  48.98 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  41.1 
 
 		 572 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  41.18 
 
 		 575 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 581 aa  136  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  45.27 
 
 		 595 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  40.64 
 
 		 590 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  44.44 
 
 		 575 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  45.58 
 
 		 574 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  44.76 
 
 		 616 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  48.98 
 
 		 575 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  43.83 
 
 		 556 aa  133  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  47.22 
 
 		 642 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.48 
 
 		 645 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  46.26 
 
 		 573 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  47.22 
 
 		 645 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  44.06 
 
 		 635 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.97 
 
 		 564 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  41.58 
 
 		 520 aa  127  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  40.82 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.94 
 
 		 574 aa  123  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  40.14 
 
 		 551 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  40.82 
 
 		 559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  35.35 
 
 		 586 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  40.14 
 
 		 559 aa  113  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.14 
 
 		 574 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  33.48 
 
 		 619 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  37.87 
 
 		 603 aa  110  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 464 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.87 
 
 		 553 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  37.01 
 
 		 594 aa  107  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  40.14 
 
 		 585 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  35 
 
 		 619 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3601  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 603 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.36082  normal  0.484683 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 621 aa  100  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 621 aa  100  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 573 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 642 aa  99.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  34.93 
 
 		 677 aa  99  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 621 aa  97.1  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 595 aa  94.7  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 607 aa  94  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 		 572 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 566 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.91 
 
 		 610 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  36.15 
 
 		 566 aa  90.5  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 638 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 566 aa  90.1  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  30.22 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 585 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 610 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 572 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 633 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0342  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.22 
 
 		 582 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  34.38 
 
 		 572 aa  88.6  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 599 aa  87.4  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 617 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 572 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  33.13 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 631 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.48 
 
 		 633 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  29.03 
 
 		 593 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 579 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 617 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>