More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0478 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 599 aa  1213    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  61.12 
 
 		 562 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  43.79 
 
 		 566 aa  429  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.87 
 
 		 581 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.12 
 
 		 563 aa  372  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 567 aa  176  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.86 
 
 		 572 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 568 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 572 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 573 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  28.49 
 
 		 573 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.97 
 
 		 573 aa  143  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.27 
 
 		 603 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.65 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.68 
 
 		 553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.77 
 
 		 566 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 581 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 594 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 		 632 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  28.18 
 
 		 520 aa  118  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  27.62 
 
 		 584 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  28.42 
 
 		 595 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.24 
 
 		 548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  26.9 
 
 		 575 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  26.39 
 
 		 613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 556 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 613 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 572 aa  110  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 573 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 585 aa  108  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  28.07 
 
 		 591 aa  107  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 594 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 575 aa  104  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  24.48 
 
 		 573 aa  103  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  27.4 
 
 		 590 aa  103  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.95 
 
 		 574 aa  103  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  36.55 
 
 		 583 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 573 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 592 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  37.24 
 
 		 592 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  37.24 
 
 		 592 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 599 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  32.28 
 
 		 595 aa  101  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.4 
 
 		 594 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  31.48 
 
 		 635 aa  100  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  37.41 
 
 		 619 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  40.15 
 
 		 642 aa  100  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 572 aa  99.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  36.64 
 
 		 593 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  26.69 
 
 		 575 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 566 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  25.2 
 
 		 574 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  35.92 
 
 		 425 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  26.65 
 
 		 609 aa  98.6  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  28.94 
 
 		 562 aa  98.6  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 616 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 607 aa  97.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 607 aa  97.4  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 607 aa  97.4  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  37.34 
 
 		 638 aa  97.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  28.22 
 
 		 551 aa  96.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  31.6 
 
 		 677 aa  96.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 607 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  28.47 
 
 		 645 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  43.51 
 
 		 572 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  34.35 
 
 		 593 aa  95.1  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.02 
 
 		 645 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 607 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  24.47 
 
 		 607 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 607 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 607 aa  94.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  43.81 
 
 		 566 aa  94  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  25.45 
 
 		 606 aa  93.6  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.15 
 
 		 564 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  24.87 
 
 		 606 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  24.87 
 
 		 606 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 606 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  24.87 
 
 		 606 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 		 606 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  24.87 
 
 		 606 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  24.87 
 
 		 606 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 621 aa  91.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  26.61 
 
 		 586 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  33.97 
 
 		 621 aa  89  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  27.3 
 
 		 584 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  23.68 
 
 		 625 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  33.97 
 
 		 621 aa  89  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  36.5 
 
 		 584 aa  89.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 573 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0954  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 595 aa  88.6  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 		 804 aa  88.6  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  26.47 
 
 		 642 aa  88.2  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 576 aa  87.8  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>