More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2098 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
566 aa  1150    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  52.65 
 
 
568 aa  594  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  47.85 
 
 
573 aa  528  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  46.29 
 
 
573 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  45.02 
 
 
573 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.2 
 
 
572 aa  474  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.13 
 
 
572 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
567 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
594 aa  210  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
594 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.13 
 
 
557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  25.08 
 
 
632 aa  171  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
722 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 
563 aa  152  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 
878 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
565 aa  150  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.54 
 
 
1676 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.08 
 
 
610 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 
610 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.31 
 
 
581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.97 
 
 
810 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 
592 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.67 
 
 
599 aa  140  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.31 
 
 
553 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  23.92 
 
 
603 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  31.27 
 
 
619 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.14 
 
 
594 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
622 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 
631 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  25.52 
 
 
592 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.34 
 
 
633 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.49 
 
 
1737 aa  137  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  30.83 
 
 
583 aa  137  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.19 
 
 
1694 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
927 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  31.76 
 
 
584 aa  133  9e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.32 
 
 
2240 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.6 
 
 
633 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
617 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  28.77 
 
 
593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  28.77 
 
 
593 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 
572 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
617 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  29.34 
 
 
677 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  25.63 
 
 
621 aa  127  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 
638 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
607 aa  127  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
621 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  25.43 
 
 
621 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 
511 aa  124  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 
619 aa  124  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
579 aa  123  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 
581 aa  120  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
566 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
4079 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 
3172 aa  117  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
543 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  30.27 
 
 
566 aa  115  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 
486 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 
562 aa  114  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 
566 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
1061 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
1486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.89 
 
 
837 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
566 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 
1276 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  30.6 
 
 
425 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  24.71 
 
 
573 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.18 
 
 
936 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.16 
 
 
988 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  26.59 
 
 
585 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 
592 aa  108  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  24.7 
 
 
613 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.55 
 
 
745 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 
595 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.17 
 
 
548 aa  106  9e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
556 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 
572 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.33 
 
 
729 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
607 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
607 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  23.48 
 
 
607 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
576 aa  105  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 
613 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
607 aa  104  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.31 
 
 
397 aa  103  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 
1069 aa  103  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 
574 aa  103  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  23.56 
 
 
562 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  23.08 
 
 
586 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 
750 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 
448 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
607 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
607 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  31.06 
 
 
551 aa  101  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 
1297 aa  100  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 
3145 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  23.28 
 
 
606 aa  99.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>