More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1861 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 565 aa  1153    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.82 
 
 		 563 aa  355  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.03 
 
 		 599 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 		 562 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 566 aa  325  9e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.38 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 567 aa  195  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 573 aa  171  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.75 
 
 		 572 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.9 
 
 		 572 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  27.26 
 
 		 573 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  36.47 
 
 		 632 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  25.65 
 
 		 573 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.54 
 
 		 557 aa  117  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.51 
 
 		 603 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.51 
 
 		 553 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 722 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  36.54 
 
 		 638 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  35.76 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  29.03 
 
 		 619 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 566 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  28.76 
 
 		 572 aa  104  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 610 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  29.83 
 
 		 617 aa  103  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04546  tetratricopeptide repeat family  30.24 
 
 		 551 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  31.76 
 
 		 593 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  36 
 
 		 584 aa  100  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  22.2 
 
 		 594 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 579 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  30.65 
 
 		 593 aa  100  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 592 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.01 
 
 		 610 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  29.55 
 
 		 592 aa  97.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  30.1 
 
 		 677 aa  97.1  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 581 aa  96.7  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 607 aa  97.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  35.21 
 
 		 566 aa  96.7  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 621 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.28 
 
 		 548 aa  95.9  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0723  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.76 
 
 		 564 aa  95.5  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.686717  normal  0.618233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  28.57 
 
 		 583 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 613 aa  94.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.21 
 
 		 594 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 572 aa  92.8  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 642 aa  93.2  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 804 aa  93.2  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1676 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.19 
 
 		 574 aa  93.2  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 572 aa  92.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  29.68 
 
 		 621 aa  89.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0827  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 574 aa  89.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0963387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  36.22 
 
 		 621 aa  89  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.66 
 
 		 2240 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.24 
 
 		 571 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  26.03 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0898  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 599 aa  88.6  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 767 aa  88.2  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  26.91 
 
 		 586 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 613 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4130  hypothetical protein  23.2 
 
 		 613 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.533551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  29.06 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  24.46 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 576 aa  85.1  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 595 aa  84.7  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  23.33 
 
 		 574 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  26.87 
 
 		 616 aa  83.6  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.57 
 
 		 571 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0992  TPR repeat-containing protein  36.69 
 
 		 464 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.37346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.22 
 
 		 882 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 607 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  26.26 
 
 		 575 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 573 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 586 aa  80.5  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 607 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 607 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 607 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 599 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 607 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  22.47 
 
 		 607 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.19 
 
 		 633 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 631 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 622 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 607 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 617 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 878 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 552 aa  77.8  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.11 
 
 		 633 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  25.5 
 
 		 635 aa  77.8  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.88 
 
 		 882 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 573 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 511 aa  76.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 		 592 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>