More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1767 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  47.23 
 
 		 864 aa  772    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  45.68 
 
 		 883 aa  763    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  95.35 
 
 		 882 aa  1669    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  100 
 
 		 882 aa  1769    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  48.42 
 
 		 860 aa  823    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  57.21 
 
 		 884 aa  991    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.85 
 
 		 884 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 886 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.05 
 
 		 883 aa  343  7e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 886 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 934 aa  183  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 931 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.86 
 
 		 1056 aa  161  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  23.09 
 
 		 929 aa  157  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.79 
 
 		 988 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.82 
 
 		 1056 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.7 
 
 		 729 aa  144  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.42 
 
 		 1022 aa  141  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.58 
 
 		 2240 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.3 
 
 		 810 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 878 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.81 
 
 		 784 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.77 
 
 		 818 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1676 aa  128  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 748 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 		 786 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 729 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 927 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 		 4079 aa  119  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 927 aa  115  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 800 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 1069 aa  112  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 847 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 923 aa  107  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 722 aa  104  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 873 aa  104  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 566 aa  104  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  22.18 
 
 		 955 aa  102  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  23 
 
 		 568 aa  102  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  25.2 
 
 		 573 aa  100  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 944 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 		 582 aa  97.8  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 767 aa  97.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  21.34 
 
 		 924 aa  96.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 3145 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 624 aa  95.5  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 573 aa  95.1  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.81 
 
 		 1979 aa  94.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.51 
 
 		 750 aa  94  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  24.37 
 
 		 924 aa  94  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.14 
 
 		 1737 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  20.94 
 
 		 1056 aa  92.8  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.44 
 
 		 935 aa  92  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 620 aa  91.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  20.98 
 
 		 567 aa  91.3  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  23.58 
 
 		 917 aa  89.7  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23 
 
 		 979 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  30.33 
 
 		 632 aa  88.2  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.69 
 
 		 573 aa  87.8  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 		 1421 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20.87 
 
 		 1276 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.81 
 
 		 557 aa  84  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.06 
 
 		 924 aa  84  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.85 
 
 		 572 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 649 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 		 579 aa  82.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 		 632 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  20.68 
 
 		 892 aa  83.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.58 
 
 		 887 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 		 758 aa  83.2  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  20.65 
 
 		 804 aa  82.4  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  22.19 
 
 		 764 aa  81.6  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  20.24 
 
 		 1049 aa  82  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 592 aa  81.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  23.92 
 
 		 638 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.38 
 
 		 745 aa  81.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 592 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.13 
 
 		 1694 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 		 767 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  20.58 
 
 		 3301 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 3172 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 952 aa  80.1  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.33 
 
 		 875 aa  80.1  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 827 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 602 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 566 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  20.19 
 
 		 605 aa  78.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.5 
 
 		 689 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 900 aa  78.2  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  31 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 543 aa  77.8  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  20.45 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1112 aa  77.8  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 622 aa  77.8  0.0000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 		 634 aa  77  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  23.86 
 
 		 621 aa  77.4  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>