More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0195 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 931 aa  1859    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  38 
 
 		 929 aa  547  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 927 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  32.4 
 
 		 934 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  33.3 
 
 		 923 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  31.61 
 
 		 924 aa  364  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 944 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 952 aa  282  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 955 aa  229  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.75 
 
 		 935 aa  212  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  24.97 
 
 		 918 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 		 900 aa  183  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 		 883 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.13 
 
 		 884 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 860 aa  180  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.84 
 
 		 882 aa  174  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  26.56 
 
 		 864 aa  168  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  23.15 
 
 		 924 aa  164  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.58 
 
 		 924 aa  162  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 884 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.1 
 
 		 882 aa  151  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  22.82 
 
 		 931 aa  141  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 886 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  22.92 
 
 		 892 aa  130  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 873 aa  127  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  23.24 
 
 		 917 aa  126  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  24.51 
 
 		 933 aa  125  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  23.68 
 
 		 914 aa  123  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.83 
 
 		 883 aa  122  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  23.49 
 
 		 940 aa  122  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  21.82 
 
 		 937 aa  110  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  24.29 
 
 		 924 aa  108  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.54 
 
 		 557 aa  107  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  20.27 
 
 		 880 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 729 aa  106  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  22.5 
 
 		 729 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 917 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 786 aa  104  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 1069 aa  97.8  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.32 
 
 		 2240 aa  89  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.55 
 
 		 1067 aa  87.4  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.31 
 
 		 988 aa  84.7  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 586 aa  84.3  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1676 aa  83.2  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 886 aa  82  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.77 
 
 		 1056 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 808 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 827 aa  79.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 543 aa  79.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0951  tetratricopeptide TPR_2  26.3 
 
 		 613 aa  79.3  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 1371 aa  79  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 634 aa  78.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.23 
 
 		 602 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  27.04 
 
 		 574 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.39 
 
 		 689 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.04 
 
 		 878 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.99 
 
 		 577 aa  76.6  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.86 
 
 		 758 aa  77  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.82 
 
 		 810 aa  74.7  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 		 553 aa  74.7  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.18 
 
 		 603 aa  74.3  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  25.18 
 
 		 939 aa  74.3  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0589  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2934  TPR domain-containing protein  24.07 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3116  TPR domain-containing protein  24.07 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.56398  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  26.01 
 
 		 733 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0573  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.054966  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0757  hypothetical protein  24.07 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0084  TPR domain-containing protein  24.07 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1506  TPR domain-containing protein  24.07 
 
 		 606 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000406366  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 1297 aa  72.8  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 607 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 607 aa  70.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 		 556 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6129  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 607 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00611296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.66 
 
 		 573 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.78 
 
 		 818 aa  68.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 		 4079 aa  68.2  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  25.93 
 
 		 573 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 573 aa  67.8  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 767 aa  67.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  26.43 
 
 		 575 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 3145 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.44 
 
 		 573 aa  67.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  23.38 
 
 		 606 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.8 
 
 		 1022 aa  67  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 740 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 		 573 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.4 
 
 		 1486 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.78 
 
 		 784 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  20.11 
 
 		 1056 aa  66.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.16 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 847 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2120  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1406 aa  64.7  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>