More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0691 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  67.95 
 
 		 886 aa  1173    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  100 
 
 		 883 aa  1762    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 		 886 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  33.64 
 
 		 864 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 884 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.79 
 
 		 884 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.74 
 
 		 882 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 883 aa  348  4e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  31.05 
 
 		 882 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 860 aa  330  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1676 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 934 aa  147  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  24.56 
 
 		 929 aa  145  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 952 aa  128  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 931 aa  127  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  26.12 
 
 		 729 aa  127  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 878 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  25.16 
 
 		 924 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.79 
 
 		 1694 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.51 
 
 		 810 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1069 aa  118  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.76 
 
 		 2240 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 4079 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  24.94 
 
 		 923 aa  104  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  23.35 
 
 		 924 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.88 
 
 		 1056 aa  101  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.53 
 
 		 935 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 639 aa  98.6  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 632 aa  95.1  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.18 
 
 		 887 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 505 aa  93.2  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 		 448 aa  91.3  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 		 917 aa  90.9  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.77 
 
 		 1056 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.69 
 
 		 1979 aa  90.9  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 800 aa  90.5  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.85 
 
 		 725 aa  89.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  23.09 
 
 		 562 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 827 aa  89.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 566 aa  89  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 		 594 aa  87.8  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.57 
 
 		 927 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.97 
 
 		 1022 aa  85.1  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.41 
 
 		 818 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 543 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  32.34 
 
 		 725 aa  84.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.62 
 
 		 924 aa  84  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 		 689 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 		 1276 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 		 729 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.85 
 
 		 571 aa  81.6  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 2262 aa  81.6  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.71 
 
 		 1486 aa  81.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 		 567 aa  81.3  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 722 aa  80.9  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 		 573 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1138 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  24.81 
 
 		 936 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.52 
 
 		 795 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.56 
 
 		 733 aa  79.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  25.38 
 
 		 933 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.5 
 
 		 1737 aa  79  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 		 486 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 448 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 900 aa  79  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.46 
 
 		 784 aa  78.6  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 562 aa  77.8  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.24 
 
 		 647 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.29 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 808 aa  77.4  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 1406 aa  77  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 643 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  23.05 
 
 		 561 aa  77.4  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.05 
 
 		 561 aa  77.4  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  18.49 
 
 		 2059 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 847 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4608  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1404 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.406661 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 944 aa  76.3  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 3145 aa  76.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 622 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 767 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.21 
 
 		 767 aa  75.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 3172 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 		 632 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.7 
 
 		 1013 aa  75.1  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 927 aa  75.1  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.31 
 
 		 573 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.67 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  24.38 
 
 		 586 aa  73.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.72 
 
 		 988 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 2262 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  19.95 
 
 		 676 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 		 624 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 		 582 aa  72.8  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  21.76 
 
 		 892 aa  71.6  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.5 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.88 
 
 		 602 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.89 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 		 614 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>