More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2367 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  51.38 
 
 		 864 aa  884    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  52.89 
 
 		 884 aa  915    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  48.42 
 
 		 882 aa  811    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  46.18 
 
 		 883 aa  796    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 860 aa  1741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  48.42 
 
 		 882 aa  817    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  33.85 
 
 		 884 aa  473  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 886 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 		 886 aa  326  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  29.08 
 
 		 883 aa  325  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 934 aa  181  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 931 aa  180  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 878 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  22.06 
 
 		 929 aa  171  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.12 
 
 		 810 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.92 
 
 		 988 aa  161  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.66 
 
 		 1056 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.55 
 
 		 1022 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.09 
 
 		 1056 aa  145  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.28 
 
 		 2240 aa  144  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.27 
 
 		 729 aa  144  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1676 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 927 aa  140  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 4079 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 927 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.66 
 
 		 818 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.97 
 
 		 1979 aa  126  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.7 
 
 		 1694 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.5 
 
 		 786 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.68 
 
 		 784 aa  122  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.54 
 
 		 573 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 722 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 		 1069 aa  111  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 568 aa  111  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 605 aa  111  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.47 
 
 		 3301 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.98 
 
 		 573 aa  109  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 729 aa  108  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 3145 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.14 
 
 		 1737 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.14 
 
 		 573 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 		 3172 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 900 aa  107  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 923 aa  107  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.19 
 
 		 887 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 		 873 aa  105  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 1421 aa  105  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1138 aa  104  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.27 
 
 		 725 aa  104  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.27 
 
 		 935 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.4 
 
 		 557 aa  103  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.88 
 
 		 632 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  22.86 
 
 		 924 aa  102  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 566 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 594 aa  102  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 649 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.02 
 
 		 1297 aa  100  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.73 
 
 		 572 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 572 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  21.92 
 
 		 632 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 847 aa  99.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  21.08 
 
 		 892 aa  98.6  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 543 aa  97.8  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.75 
 
 		 764 aa  97.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  21.49 
 
 		 924 aa  97.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.65 
 
 		 1276 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  22.43 
 
 		 936 aa  96.3  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.68 
 
 		 733 aa  95.9  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  21.02 
 
 		 392 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 465 aa  95.5  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 824 aa  95.1  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.96 
 
 		 566 aa  95.1  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.72 
 
 		 624 aa  94.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  19.53 
 
 		 1486 aa  94.4  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  21.64 
 
 		 767 aa  94  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  22.07 
 
 		 924 aa  94  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 		 750 aa  93.6  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.47 
 
 		 567 aa  92  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.05 
 
 		 1056 aa  91.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 944 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.98 
 
 		 462 aa  90.1  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  19.81 
 
 		 676 aa  89.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  22.05 
 
 		 800 aa  89.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 602 aa  88.6  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.43 
 
 		 732 aa  88.6  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  27.33 
 
 		 626 aa  88.2  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  21.21 
 
 		 924 aa  88.6  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 562 aa  88.2  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.76 
 
 		 639 aa  88.2  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27 
 
 		 614 aa  87.8  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 614 aa  87.8  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27 
 
 		 614 aa  87.8  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27 
 
 		 626 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27 
 
 		 626 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 614 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  20.2 
 
 		 594 aa  87.4  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.9 
 
 		 689 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 808 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.14 
 
 		 1013 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  21.17 
 
 		 576 aa  85.5  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>